کیست هیداتید بیماری مشترک بین انسان و دام در سطح جهانی است که از لحاظ اقتصادی حائز اهمیت میباشد و به عنوان تهدیدی برای بهداشت عمومی در بسیاری از کشورها در نظر گرفته شده است.مطالعات مختلف نشان داده اند که کیست هیداتید معمولا در گاو، گوسفند، شتر و بز در سراسر ایران یافت می شود. یافته های اخیر در ساختارهای ژنتیکی و مورفولوژیکی جمعیت های اکینوکوکوس گرانولوزوس سویه های 10g-1g را در این جنس تایید می کند. در این مطالعه تعداد 70 ارگان آلوده به کیست هیداتیک از گاوهای کشتارشده در کشتارگاههای مشهد واهواز جمع آوری و به آزمایشگاه منتقل شد. استخراج dna از لایه زایای کیست ها برای انجام کارهای مولکولی با کیت تجاری mbst انجام گردید.سپس dna استخراج شده همراه با پرایمرهای طراحی شده برروی ژن its1 در واکنش زنجیره ای پلیمراز (pcr ) مورد استفاده قرار گرفت.برای تعین سویه از محصول pcr از روش rflp با آنزیم bsh 1236i استفاده شد و در همه ی نمونه ها سویه های g1-3 (سنسواستریکتو) شناسایی گردید.در ادامه 2 نمونه از نمونه های اهواز و3 نمونه از نمونه های مشهد که دارای الگوی برش متفاوتی بودند تعیین توالی شدند.نتایج تعیین توالی ژن its 1 از نمونه های مشهد 99% همولوژی با سویه گوسفندی ((g1 و نتایج تعیین توالی ژن its1 از نمونه های اهواز 98% همولوژی با سویه گوسفندی (g1 ) نشان داد. پژوهش حاضر اولین مطالعه ی مولکولی انجام شده جهت شناسایی سویه های کیست هیداتیک گاوی در شهرستان های مشهد و اهواز می باشد که وجود سویه ی g1 را در این مناطق تأیید می کند.