دو چیز که تقریبا در تمام قسمت های جهان وجود دارد، ذرات باردار و پلاسما هستند. اثر متقابل این دو به عنوان یکی از موضوعات جالب در فیزیک پلاسما به شمار می رود که پلاسمای غبارآلود نام دارد. پلاسمای غبارآلود یک گاز یونیزه شده حاوی ذرات غبار بااندازه های مختلف از ده ها نانومتر تا صدها میکرون می باشد. زمانی که میانگین انرژی پتانسیل الکترواستاتیک به طور قابل ملاحظه ای بیشتر از میانگین انرژی جنبشی باشد، کریستال پلاسمای غبارآلود در پلاسمای غبارآلود رخ می دهد. پیکربندی کریستال ها به طور معمول، در لایه های دو بعُدی به صورت هگزاگونال (شش ضلعی)می باشند. توسعه آزمایشگاه برای مطالع? پلاسمای غبارآلود اغلب گران قیمت بوده و انجام آزمایش های عملی مشکل می شود. یکی از راه های جبران این ناتوانی، شبیه سازی محیط آزمایشگاه به وسیل? کامپیوتر می باشد. در این پایان نامه، پس از مرور کلی بر پلاسمای غبارآلود، با استفاده از روش شبیه سازی دینامیک مولکولی، به بررسی حرکت ذرات غبار تحت پتانسیل یوکاوا و چگونگی تشکیل کریستال هگزاگونال پرداخته شده است.