caga یک پروتئین باکتریایی 120 تا 145 کیلو دالتون است که نقش بسیار مهمی در بروز بیماری¬های گوارشی دارد و باعث افزایش خطر ابتلا به بیماری¬های زخم معده، آتروفی معده و سرطان معده می¬شود. پروتئین caga دارای ناحیه¬ی تکرارپذیر epiya (گلوتامین- پرولین- ایزولوسین- تیروزین-آلانین) بسیار پلی¬مورف در ناحیه¬ی انتهای کربوکسیلی می¬باشد. هدف از این مطالعه تعیین تعداد و انواع موتیف epiya در ناحیه¬ی متغیر 3 از میان سویه¬های هلیکوباکترپیلوری می¬باشد که به وسیله¬ی تکنیک pcr و تعیین توالی dna ارتباط بین موتیف¬ها و بیماری¬های گوارشی مشخص شد. سویه¬های هلیکوباکترپیلوری از 170 بیمار مبتلا به گاستریت، 36 بیمار مبتلا به سرطان معده و 58 بیمار که دارای عارضه¬ی زخم معده بودند و به مراکز آندوسکوپی شهرهای مختلف ایران مراجعه کرده بودند به دست آمد. در مجموع 149 نمونه از سویه¬های جدا شده +caga بودند و انواع مختلفی از موتیف¬ها را در ناحیه¬ی c ترمینال نشان دادند. آنالیز آماری ارتباط معنی دار قوی بین حضور ژن caga و بروز بیماری زخم معده نشان داد )00/0p= ،133/15-829/2 ، ci95% ،543/6(odds ratio (or) . فراوانی کلیepiya-ab 3/3?، epiya-abc 5/71?، epiya-abcc 4/15? و epiya-abccc 3/7? بدست آمد. آزمون¬های آماری ارتباط معنی دار بین حضور موتیفepiya-abcc با زخم معده (01/0p=) و نیز ارتباط معکوس بین حضور موتیف epiya-abc را با زخم معده نشان داد)007/0p=). نتایج تحلیل رگرسیون ارتباط معنی دار قوی بین حضور موتیف epiya-abccc و بروز سرطان معده نشان داد (003/0p= ،88/45-17/2 ، ci95% ،99/9(odds ratio (or) . آنالیز¬ رتبه ای واریانس مولکولی برای انواع موتیف ها تفاوت معنی داری بین مناطق جغرافیایی مختلف در ایران نشان نداد (05/0p> ). نتایج این مطالعه پیشنهاد می¬کند که عفونت با سویه¬های هلیکوباکترپیلوری +caga دارای موتیفepiya-abcc با زخم معده و موتیف epiya-abccc با سرطان معده ارتباط معنی دار قوی نشان می دهد. تفاوت در ژنوتیپ caga ممکن است شاخص مهمی در اپیدمیولوژی مولکولی باشد و نقش مهمی در بروز علایم بالینی متفاوت ناشی از عفونت با سویه¬های هلیکوباکترپیلوری +caga داشته باشد