پژوهش حاضر با هدف مطالعه اثرات ضد میکروبی هفت گونه سیانوباکتری nostoc sp. isc 101 ،anabaena sp. isc 55 ، cyanobacterium ihb.، geitleronama sp.، .oscillatoria sp، phormidium sp. و. calotrix sp. به منظور کنترل بیولوژیک دو قارچ بیماری¬زای گیاهیfusarium oxysporum f.sp lycopersici و rhizoctonia solani و سه گونه باکتری بیماری¬زای انسانی ,escherichia coli klebsiella pneumoniaeو staphylococcus aureus در پژوهشکده خلیج فارس (بوشهر) در طی مهرماه 1391 تا خرداد 1392 انجام گردید. دو گونه از هفت سیانوباکتری مورد مطالعه از نمونه آب دریا جداسازی و خالص سازی گردیدند. شناسایی مولکولی جدایه¬های سیانوباکتری بدست آمده از نمونه آب دریا به روش توالی یابی 16srrna انجام گرفت. در بررسی جدایه¬های سیانوباکتری¬های مورد آزمون، nostoc sp. با ایجاد 53/94و 73/59 درصد کاهش رشد در غلظت 100% عصاره متانولی و در روز پنجم و همینطور با ایجاد 77/65 و 47/67 درصد کاهش وزن خشک در غلظت 100% عصاره، بهترین اثرات ضد قارچی را به ترتیب علیه r. solani وf. oxysporum f.sp lycopersici نشان داد. بهینه¬سازی محیط کشت سیانوباکتری cyanobacterium ihb به منظور افزایش اثرات ضدقارچی، با تغییر در مقدار دو عامل از محیط کشت bg11، شامل منابع نیتروژن ( (nano3و فسفات (k2hpo4) مورد بررسی قرار گرفت. در این بررسی بهترین اثرات ضدقارچی بر روی r. solaniوf. oxysporum f.sp lycopersici در مقدار سه گرم nano3 و 02/0 گرم k2hpo4با 17/89 و 00/87 درصد کاهش رشد بدست آمد. دربررسی ضد باکتریایی جدایه¬های سیانوباکتری نیز جدایه¬ی nostoc sp با ایجاد هاله¬ عدم رشد 43/19، 26/18 و 90/21 سانتی¬متری به ترتیب در غلظت-های 50، 100 و 150 میکرولیتر بیشترین اثر ضدباکتریایی روی k. pneumoniae،s.aureus و e. coli را از خود نشان داد.