اخیراً رأی گیری اینترنتی به دلیل سرعت، شمارش اتوماتیک، کاهش هزینه، امکان خطای کم، حضور بیشتر در انتخابات و شفافیت زیاد، محبوبیت زیادی کسب کرده است اما چالش های موجود برای پیاده سازی یک سیستم رأی گیری امن قابل توجه هستند. اگر این سیستم ها به دقت طراحی و پیاده سازی نشوند باعث تضعیف شدن اعتماد رای دهندگان به کل فرآیند رای گیری خواهد شد. در این پژوهش یک پروتکل رأی گیری اینترنتی طراحی و پیشنهاد گردیده است که نیازمندیهای امنیتی مطلوب یک سیستم رای گیری را تضمین می کند. اگرچه سیستم های رأی گیری اینترنتی قابلیت جا بجایی رأی دهنده را با فراهم کردن امکان رأی دادن رأی دهنده با استفاده از کامپیوتر های شخصی فراهم می کنند، اما آنها در مقابل بد افزار ها و حملات پیچیده شبکه ای بسیار آسیب پذیر هستند. ناامن بودن پلتفرم سمت رأی دهنده، یکی از بزرگترین موانع پیاده سازی سیستم های رأی گیری اینترنی می باشد که می تواند به منجر فاش شدن هویت رأی دهنده شود و هم چنین کل فرآیند رأی گیری را تحت تاثیر قرار می دهد. بنابراین، ما جایگزینی را برای پلتفرم ناامن سمت رای دهنده ارائه می کنیم. جاوا کارت 3 آخرین نسخه جاوا کارت می باشد که می تواند به عنوان وب سرور امن قابل حمل رأی دهنده در نظر گرفته شود. جاوا کارت 3 می تواند آدرس آیپی بگیرد و به عنوان گره ای از شبکه با گره های دیگر از طریق http/ https ارتباط برقرار کند. جاوا کارت 3 می تواند چالش های امنیتی را که بوسیله ناامن بودم کامپیوتر های رأی دهندگان به وجود آمده است را حل کند. بنابراین، در این پژوهش علاوه بر ارائه یک پروتکل امن رأی گیری اینترنتی، برای تضمین امنیت سمت رای دهده از ایده جاوا کارت3 بعنوان جایگزینی امن برای ترمینال های رای گیری استفاده شده است. هم چنین، پیاده سازیی از پروتکل پیشنهادی نیز با استفاده از جاوا کارت 3 ارائه شده است.