هندوانه با نام علمی citrullus lanatus گیاهی از خانواده کدوئیان (cucurbitacae) است. بر پایه ی گزارش فائو، ایران یکی از چهار کشور بزرگ تولید کننده این محصول است. بیماری آب گزیدگی میوه ی هندوانه از مهمترین بیماری باکتریایی این محصول به شمار آمده و هر ساله باعث ایجاد زیان کمی و کیفی این محصول در جهان می شود. از آنجا که در بازدیدهای انجام شده از کشتزارهای استان همدان نشانه هایی همانند با آب گزیدگی میوه هندوانه دیده شد، این پژوهش برای بررسی ویژگی-های فنوتیپی و گوناگونی عامل بیماری انجام شد. در تابستان 1391 نمونه برداری از کشتزارهای آلوده انجام شد و بررسی های لازم برای شناسایی عامل بیماری و تنوع آن انجام شد. اثبات بیماریزایی با تزریق سوسپانسیون باکتری به پوست میوه سالم هندوانه انجام شد. در مجموع تعداد 10 استرین به عنوان نماینده برای شناسایی انتخاب شد. بررسی ویژگی های فنوتیپی استرین ها به روش های استاندارد باکتری شناسی انجام شد. نتایج نشان داد که استرین ها مربوط به جنس pectobacterium هستند. برای شناسایی مولکولی استرین ها از جفت آغازگر pccssf/pccssr جهت انجام واکنش زنجیره ای پلیمراز استفاده شد. محصول این واکنش برای توالی یابی به کشور کره جنوبی ارسال شد. توالی به دست آمده با توالی های ثبت شده در بانک اطلاعات ژنومی به روش بلاست مورد مقایسه قرار گرفت. استرین نماینده جدا شده از هندوانه با pectobacterium caratovorum subsp. caratovorum شباهت 99 درصدی داشت. برای بررسی گوناگونی ژنتیکی استرین ها از جفت آغازگر eric1/eric2 در واکنش زنجیره ای پلیمراز استفاده شد. نتایج نشان داد استرین ها از نظر ژنتیکی دارای گوناگونی هستند و کاملا یکسان نیستند. آزمون گلخانه ای برای بررسی تاثیر استرین ها بر شدت بیماریزایی نشان داد که استرین hd15 بیشترین (60 درصد) و استرین hd5 کمترین (8 درصد) شدت بیماریزایی را روی گیاهچه هندوانه ایجاد کرد.