ارزیابی dna ژنومی زنبورها در استان کرمان با دو آغازگر issr انجام شد. با استفاده از این آغازگرها 16 قطعه dna تکثیر شد که همه چند شکل بودند. تعداد قطعات تولید شده در پروفایل های dna شهرهای مختلف از 2 تا 8 قطعه، با اندازه هایی که از 150 تا 1000 جفت باز متغییر بود. تنوع ژنتیکی افراد 6 شهر با نشانگرهای (ac)8g و (agac)4gc در pcr آشکار شد و پروفایل های dna به دست آمد. قطعات با استفاده از issr-pcr تولید شد. میانگین شاخص شانون بر اساس نشانگر (ac)8g برای جمعیت زنبور عسل جیرفت، کرمان، فلو (زنبور بومی جیرفت)، راین، رابر و بردسیر به ترتیب 52/0، 36/0، 50/0، 61/0، 42/0 و 19/0 بود و بر اساس نشانگر(agac)4gc برای جمعیت زنبور عسل جیرفت، کرمان،آپیس فلورا (زنبور بومی جیرفت)، راین، رابر و بردسیر به ترتیب 52/0، 51/0، 46/0، 39/0، 41/0 و 27/0 بود. آنالیز خوشه ای با استفاده از روش upgma انجام شد و دندروگرام رابطه ژنتیکی بین 30 فرد در 6 جمعیت به دست آمد. هاپلوتیپ ها محاسبه شد و فراوانی ها در هر جمعیت مقایسه گردید. نتایج این پژوهش می تواند اطلاعات ملکولی پایه ای برای مطالعه بیشتر روی زنبورهای عسل بومی با نشانگرهای issr فراهم آورد، چرا که می توان توالی ناشناخته آنها را شناسایی و تعیین توالی نمود.