هدف اصلی این پژوهش شناسایی چالش های اساسی دیوان محاسبات کشور برای اجرای حسابرسی عملکرد است. با مروری بر پیشینه مطالعات و تحقیقات انجام شده، چالش های اساسی دیوان محاسبات کشور برای اجرای حسابرسی عملکرد در قالب هشت چالش اساسی مشخص گردید. به منظور تعیین وزن چالش های احصاء شده، پرسشنامه ای بر اساس فرآیند تحلیل سلسله مراتبی (ahp) طرح ریزی و بین متخصصان و خبرگان توزیع گردید. متخصصان و خبرگان برگزیده گروهی از حسابرسان کل دیوان محاسبات کشور بوده که سالها در حوزه حسابرسی سابقه کار داشته و در زمینه حسابرسی عملکرد با تجربه و صاحبنظر می باشند. با جمع آوری نظر متخصصان و خبرگان وزن نسبی هر یک از چالش ها مشخص گردید و شش چالش اساسی که از اهمیت وزن بیشتری برخوردار بوده مستقیماً وارد مدل تحقیق گردیدند. در گام بعدی با در نظر گرفتن مطالب تئوریک بررسی شده، برای هر یک از چالش های اساسی سوالاتی طراحی و در قالب پرسشنامه در جامعه آماری این تحقیق (کلیه کارکنان شاغل در حوزه معاونت فنی و حسابرسی امور عمومی و اجتماعی دیوان محاسبات کشور شامل مدیران و حسابرسان به تعداد 131 نفر) توزیع گردید. در نهایت فرضیات پژوهش با آزمونهای کولموگروف- اسمیرنف، تی یک جامعه و تی دو جمله ای مورد آزمون قرار گرفت. همچنین با استفاده از آزمون فریدمن متغیرهای مستقل تحقیق رتبه بندی شد. نتایج حاصل از تجزیه و تحلیل داده ها نشان داد فقدان استانداردهای حسابرسی عملکرد در بخش دولتی، کمبود آموزش، تخصص و مهارت لازم حسابرسان، عدم اجرای توصیه های حسابرسی عملکرد، عدم کفایت سامانه های اطلاعاتی موجود برای ارائه شواهد قابل اتکاء، مقاومت مدیران بخش دولتی در برابر اجرای حسابرسی عملکرد و فقدان شاخص های مناسب بمنظور ارزیابی عملکرد دستگاه های اجرایی بترتیب از چالش های اساسی دیوان محاسبات کشور برای اجرای حسابرسی عملکرد محسوب می شوند.