در این پژوهش یک پیل سوختی غشا پلیمری دما بالا با استفاده از نرم افزار کامسول شبیه سازی شده است. مدل مورد استفاده در شبیه سازی یک مدل سه بعدی، تک فاز، همدما و حالت پایدار است. مقایسه نشان می دهد که نتایج شبیه سازی توافق خوبی با نتایج آزمایشگاهی دارد. همچنین در این پژوهش، اثر پارامترهایی همچون دما، فشار، سطح آلاییدن اسید، سطح بارگذاری کاتالیست آند و کاتد، استفاده از هیدروژن با 2% کربن منوکسید به عنوان سوخت، استفاده از هوا به عنوان اکسیدان، طول کانال جریان گازی و نرخ جریان گاز مورد بررسی قرار گرفته است. نتایج بیانگر این است که با افزایش دما، فشار و سطح آلاییدن اسید عملکرد پیل بهبود می یابد و در صورت کاهش بارگذاری کاتالیست آند و کاتد، استفاده از هیدروژن با 2% کربن منوکسید در آند، استفاده از هوا به جای اکسیژن در کاتد و کاهش نرخ جریان گاز عملکرد پیل کاهش می یابد. همچنین تغییر طول کانال در این نمونه ی شبیه سازی شده اثری بر عملکرد پیل سوختی غشاء پلیمری دما بالا ندارد. از طرفی پیش بینی می شود که در نمونه های دیگر از پیل های سوختی غشاء پلیمری دما بالا با شرایط عملیاتی متفاوت، افزایش طول کانال جریان باعث افت غلظت واکنش دهنده ها و در نتیجه کاهش عملکرد پیل شود.