پژوهش حاضر به مطالعه اثر اجرای سیستم های اطلاعاتی حسابداری بر عملکرد مالی شرکتهای پذیرفته شده در بورس اوراق بهادار تهران می پردازد. به منظور دستیابی به هدف موردنظر، فرضیه هایی تدوین شده و جهت آزمون این فرضیه ها، نمونه ای از بین شرکت های پذیرفته شده در بورس اوراق بهادار تهران (در دو گروه همتراز و غیر همتراز )، طی سال های 1383 لغایت 1390 انتخاب گردید. همچنین در این پژوهش به منظور اندازه گیری سیستم اطلاعاتی حسابداری از پرسش نامه و همچنین از نرخ بازده حقوق صاحبان سهام و نرخ بازده دارایی ها و نسبت قیمت به سود سهم و نسبت q توبین و برای آزمون فرضیه ها از روش رگرسیون چند متغیره استفاده شده است. یافته های پژوهش حاکی از آن است که بین اجرای مناسب سیستم اطلاعاتی حسابداری و اندازه شرکت با نرخ بازده حقوق صاحبان سهام و نرخ بازده دارایی ها و نسبت قیمت به سود سهم ونسبتq توبین در گروه همتراز رابطه مثبت و معناداری وجود دارد . همچنین بین اجرای مناسب سیستم اطلاعاتی حسابداری با نرخ بازده حقوق صاحبان سهام و نرخ بازده دارایی ها ونسبت q توبین در گروه غیر همتراز رابطه مثبت و معناداری وجود دارد ولی با نسبت قیمت به سود سهم رابطه معناداری وجود ندارد و همینطور بین اندازه شرکت با نرخ بازده حقوق صاحبان سهام در گروه غیر همتراز رابطه مثبت و معناداری وجود دارد ولی با نرخ بازده دارایی ها و نسبت قیمت به سود سهم ونسبت qتوبین رابطه معناداری وجود ندارد. با توجه به نتایج جدول رگرسیون در این تحقیق، در بین متغیرهای مستقل اجرای سیستم اطلاعاتی حسابداری در گروه غیر همتراز و متغیر مستقل اندازه شرکت در گروه همتراز دارای بیشترین تاثیر بر روی عملکرد مالی شرکتها بوده است.