در طول تاریخ شخصیت های بزرگ و انسان ساز- مخصوصاً پیامبران- همواره از سوی مخالفان کینه توز در معرض اتهامات و نسبت های ناروا قرار داشته اند و به پیامبر (ص) که برگزیده ی خلق عالم است از همان صدر اسلام اتهامات زیادی نسبت داده شد و این موضوع در دوره ی معاصر توسط مستشرقان شدت بیشتری گرفت و ملحدان هم با اسوه گیری از راه و روش آنها این تهمت ها را بازگو کردند تا در میان مسلمانان ایجاد شبهه بکنند. یکی از روش های آنها استفاده از فضای مجازی یا همان اینترنت بوده است. این تحقیق نیز با عنوان تحلیل و نقد شبهات توهین آمیز به پیامبر اکرم (ص) در فضای مجازی درصدد است تا با مراجعه به سایت های مخالفان و دشمنان اسلام به استخراج شبهات وارده پیرامون پیامبر (ص) بپردازد و پس از دسته بندی شبهات در حوزه های مختلف و مراجعه به قرآن و احادیث و کتاب های مختلف و متقن و دلایل عقلی به پاسخ این شبهه ها مبادرت ورزد. این پژوهش در گردآوری اطلاعات، از شیوه کتابخانه ای و در تحلیل بر اساس روش تحقیق توصیفی- تحلیلی عمل کرده است. و روش کار به این صورت بوده است که ابتدا به سایت های مخالف و معاند اسلام مراجعه شده و پس از استخراج شبهات با استفاده از منابع متقن به پاسخ این شبهات پرداخته شده است. این تحقیق به این نتیجه رسید: شبهاتی که در فضای مجازی مطرح شده بود بیشتر از طرف ملحدین بود و بیشتر آن ها قبلاً توسط مستشرقان ایراد شده و برخی از شبهه ها مانند دلایلی که منکران در رد معجزه های معراج و شق القمر آورده بودند؛ به روز بود. برخی از این شبهات از کتاب های تاریخی و یا حدیثی منشأ گرفته بود که مخالفان بدون بررسی سند روایت، مطرح کرده بودند از این جمله، می توان افسانه غرانیق را ذکر کرد که در کتاب تاریخ طبری آمده است. برخی دیگر از شبهات مطرح شده توسط مخالفان اسلام به علت تفسیر نادرست از آیات قرآن بود چرا که کورکورانه به قرآن مراجعه کرده و آیات صریح قرآن را طبق باب میل خود، تفسیر کرده اند، مانند آیه ختم نبوت که در متن پایان نامه به طور مفصل به آن پرداخته شده است.