مطالعات فیلوژنی زیادی بر اساس ژنوم میتوکندریایی در دیگر نقاط دنیا بر روی دوکفه¬ای¬ها تا بحال انجام شده است. بیشتر مطالعات انجام شده در ایران، بر اساس بررسی¬های ریخت¬شناسی موجودات انجام شده ولی گزارشی از بررسی¬های مولکولی بیشتر گونه¬های ایرانی از آب¬های جنوب شرقی ایران ثبت نشده است. در این پژوهش برای اولین بار پنج گونه از دوکفه¬ای¬های متعلق به زیررده pteriomorphia مناطق زیرجزرومدی چابهار مورد بررسی فیلوژنتیکی قرار گرفت. نمونه¬برداری از سه ایستگاه اسکله شهید کلانتری، اسکله شهید بهشتی و آبسنگ مرجانی سید از مناطق زیرجزرومدی چابهار از اعماق 4، 6 و 10 متری انجام شد و نمونه¬ها به آزمایشگاه انتقال داده شدند و پس از بررسی¬های مورفولوژی گونه¬ها، نمونه¬ها در فریزر 20- درجه سانتی-گراد نگهداری شدند. استخراج dna با استفاده از روش¬های مختلفی انجام شد، ولی بهترین نتیجه از روش ctab حاصل شد، سپس واکنش زنجیره¬ای پلیمراز و توالی¬یابی انجام شدند. با مقایسه توالی¬های به دست آمده از ژنوم موجود با گونه¬های دیگر که از لحاظ توالی ژنتیکی به گونه مورد بررسی نزدیک می¬باشد و یک out group، گونه¬های خلیج چابهار مورد آنالیز مولکولی قرار گرفت. توالی ژنومی گونه pteria loveniدر منطقه ژنی co1 و توالی ژنومی گونه¬های pinna bicolor، hyotissa hyotis، pinctada nigra، chlamys ruschenbergerii در منطقه ژنیrdna s18 بررسی شدند. نتایج آنالیزهای مولکولی و ترسیم درخت فیلوژنی به روش ml و nj برای هر گونه مشخص کرد که گونه¬ی pinna bicolor در کلاد خانواده pinnidae ، گونه¬ی hyotissa hyotis در کلاد خانواده gryphaeidae، گونه¬های pinctada nigra وpteria loveni در کلاد خانواده pteriidae و گونه¬ی chlamys ruschenbergerii در کلاد خانواده pectinidae زیرخانواده chlamydinae قرار گرفت. توالی ژنی گونه¬ی chlamys ruschenbergerii در بانک ژن موجود نبوده و برای اولین بار ثبت گردید. بررسی خصوصیات مورفولوژیکی نیز این نتایج را تایید کرد. همچنین سه گونه از خانواده limidae برای اولین بار شناسایی و از ایران گزارش شد که به علت محدودیت زمانی و مالی بررسی مولکولی بر روی این سه گونه انجام نشد.