مدیریت مواد زاید مراکز بهداشتی -درمانی موضوعی است که در شهرهای ایران فراموش شده است. با توجه به خطرات و معضلات زیست محیطی ایجاد شده توسط اینگونه زباله ها و آلودگی و انتقال بیماریها، روشهای جمع آوری ، حمل و نقل و دفع زباله های بیمارستانی بسیار اولیه و بدون رعایت ضوابط فنی و زیست محیطی می باشد. برای طراحی سیستم مدیریتی صحیح براساس ضوابط و رعایت نکات فنی و در نظر گرفتن عوامل زیست محیطی و بهداشتی آگاهی از کمیت و کیفیت فیزیکی و میکروبی زباله های بیمارستانی حائز اهمیت است.