نام پژوهشگر: سیده الهام رضا توفیقی

طراحی روش rt-lamp برای شناسایی ویروس عامل اسهال ویروسی گاو
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شهید چمران اهواز - دانشکده علوم 1392
  امیر تاج بخش   سیده الهام رضا توفیقی

اسهال ویروسی گاو (bvd) یک عامل بیماری زا است که در گاوها ایجاد عفونت می کند و اهمیت اقتصادی در جهان دارد. این ویروس موجب خسارات های اقتصادی قابل توجه بر صنعت دام پروری می شود. روش rt-lamp تک مرحله ای برای تشخیص ویروس اسهال ویروسی گاو بهینه شد. 4 پرایمر ویژه با استفاده از نرم افراز primerexplorer v4 برای تشخیص 6 جایگاه متمایز بر روی rna هدف قرار گرفته بر روی توالی حفاظت شده از ناحیه5?utr ژنوم ویروس bvd طراحی شد. 80 نمونه خون از گاوهای مشکوک به داشتن عفونت ویروس bvd جمع آوری شد و به طور موازی توسط دو روش rt-pcrو rt-lamp آزمایش شدند. از این میان، 24 نمونه (30%) در آزمون rt-lamp مثبت شدند. این در حالی است که تعداد 20 مورد ( 25%) در روش rt-pcrمثبت بودند. در مقایسه با روش rt-pcr، حساسیت و ویژگی برای این روش به ترتیب برابر 100% و 93/3% می باشد. مقایسه کاربرد rt-pcr و rt-lamp بر روی داده ها نشان داد که روش تکثیر هم دما به واسطه لوپ (rt-lamp) دارای حساسیت، ویژگی، سرعت و صحت بالاتری می باشد.

بررسی آلودگی سبزیجات به سالمونلا انتریکا به روش کشت و اشریشیا کلی انتروهموراژیک (ehec) به روش کشت و مولتی پلکس pcr در شهرستان اهواز
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شهید چمران اهواز - دانشکده علوم 1393
  ستاره شمس   محمد رعایایی اردکانی

اشریشیا کلی انتروهموراژیک و سالمونلا انتریکا، عوامل میکروبی هستند که قادرند از طریق مواد غذایی به انسان منتقل شده و موجب بروز بیماریهای خطرناکی شوند.در این پژوهش تعداد 256 نمونه سبزیجات تازه شامل کاهو، کلم و سبزی خوردن طی مدت 8 ماه از 4 مرکز عمده فروش سبزی در شهرستان اهواز تهیه گردید. پس از غنی سازی اولیه، از محیط های کشت ct-smac و xld به منظور جداسازی باکتری های مورد نظر استفاده شد، سپس باکتری های رشد یافته به محیط های کشت افتراقی انتقال داده شده و با تستهای اختصاصی بیوشیمیایی به عنوان اشریشیا کلی و سالمونلا تائید شدند و در مرحله بعد توسط آنتی سرم های e.coli o157:h7 و سالمونلا بررسی گردیدند. تست حساسیت ضد میکروبی به روش دیسک گذاری برای سویه های سالمونلا انجام شد. در نهایت با روش مولتی پلکس pcr حضور ژن های stx1 , stx2 ,eaea ,hlya در سویه هایe.coli o157 ارزیابی گردیداز مجموع نمونه های مورد بررسی، در12 نمونه (6/4%) باکتری سالمونلا انتریکا و در 8 نمونه (1/3%) باکتری e.coli o157 شناسایی شده و از میان آنها تنها 2 جدایه بعنوان e.coli o157:h7 تشخیص داده شدند.