پیل های سوختی غشاپلیمری را به عنوان مهمترین گزینه برای جایگزینی موتورهای احتراق داخلی می شناسند اما هنوز فاصله ی زیادی تا رسیدن به این حقیقت وجود داشته و برای رسیدن به این هدف لازم است تا بهینه سازی های زیادی روی این پیل ها صورت گیرد. مهمترین عامل محدود کننده ی عملکرد پیل های سوختی غشا پلیمری جریان دوفازی واکنش دهنده ها و محصولات است. در چگالی جریان های بالا آب چگالیده خلل و فرج لایه ی نفوذ گاز کاتد را پر کرده و به این ترتیب انتقال اکسیژن به سطح فعال کاتالیست محدود می شود. به این منظور تحلیل مشخصات پیل سوختی و بررسی تغییرات آنها در شرایط تشکیل جریان دوفازی در این پروژه با استفاده از نرم افزار کامسول جریان دوفازی در پیل سوختی غشاپلیمری شبیه سازی می شود. برای تعیین سطح اشباع در کاتدیک معادله دیفرانسیل جداگانه برای بقای جرم آب مایع حل شده و به دلیل وابستگی دیگر پارامترهای مخلوط به اشباع این پارامترها تعیین می شوند. با اضافه شدن معادله بقای بار الکتریکی به معادلات حاکم بر جریان دوفازی در پیل سوختی، سطح اشباع اصلاح شده و به تبع آن دیگر پارامترهای جریان دوغازی اصلاح می شوند.