بهینه سازی طرح یک ابزار مهم در زمینه های کاربردی، جهت دست یافتن به پیش بینی های مناسب است. در واقع با بهینه سازی و برآورد مناسب پارامترهای موجود در مدل، پیش بینی های بدست آمده نیز به واقعیت نزدیکتر خواهند بود و همین مسئله، خود اکثرمشکلاتی را که در اثر پیش بینی نادرست رابطه ی بین متغیرهای تحت کنترل و متغیر وابسته به وجود می آید، رفع می کند. در این میان مطرح کردن موضوع مقایسه های زوج شده که در جای خود می تواند موضوع گسترده ای باشد، طرح های بهینه را به سمت یافتن زوج های مناسب برای مقایسه سوق می دهد. در این پایان نامه در مدل های طرح آزمایش و رگرسیون درجه دو مقایسه ی زوج شده بکار رفته و طرح بهینه محاسبه شده است.