هدف اصلی این تحقیق شناسایی موانع اجرای حسابرسی عملیاتی در شرکت های آب و فاضلاب از دو دیدگاه ، حسابرسان مستقل سازمان حسابرسی به عنوان عرضه کننده خدمات حسابرسی عملیاتی و مدیران شرکت های آب و فاضلاب به عنوان تقاضا کننده می باشد . این تحقیق شامل هفت فرضیه مبنی بر موانع موجود از دیدگاه مدیران شرکت ها و هم چنین موانع موجود از دیدگاه مدیران حسابرسی تشکیل شده است . بخش تئوریک تحقیق ، جنبه کتابخانه ای داشته از روش قیاسی و در بخش تجربی از استقرایی بوسیله انتخاب نمونه و بکارگیری روش های جمع آوری اطلاعات از قبیل پرسشنامه با توجه به حجم نمونه مابین مدیران سازمان حسابرسی و مدیران شرکت ها توزیع شده ، که با استفاده از آزمون میانگین یک جامعه و آزمون میانگین دو جامعه به تجزیه و تحلیل نتایج تحقیق پرداخته شده است .نتایج تحقیق بیانگر تایید فرضیه ها در یک جامعه می باشد اما تفاوت دیدگاه مدیران حسابرسی و مدیران شرکت ها در فرضیه های 7 وجود دارد.