در عصر کنونی بزرگ شدن بنگاه ها پراکندگی جغرافیایی و رشد فناوری زمینه نیاز به استقرار یک سیستم کنترل داخلی اثر بخش را در مدیران سازمانها و بنگاه های بزرگ اقتصادی ایجاد کرده است. بحرانها و رسوایی های مالی جهانی اخیر نیز بیش از هر زمان بر اهمیت و ضرورت ایجاد واحد حسابرسی داخلی کارآمد و اثربخش افزوده است. مدیران با توجه به اختیارات وسیع در اعمال مدیریت منابع بنگاه وظیفه سنگینی در فرهنگ سازی درستکاری و استقرار کنترل های داخلی در جهت پیشگیری از هدر رفت منابع دارند باید با رفتار و گفتار خود ارزشها و درستکاری را در سازمان اشاعه دهند و با تقویت جایگاه اعضای غیرموظف هیئت مدیره نظام خود کنترلی بنگاه را تقویت نمایند . با تشکیل و بکارگیری واحد حسابرسی داخلی ،کمیته حسابرسی ،کمیته مدیریت خطر،کمیته برنامه ریزی راهبردی و با تقویت آنها به سازمان یاری رسانده و فعالیت های بنگاه را در چارچوب یکپارچه کنترلهای داخلی در پنج حوزه ( شامل 1- محیط کنترلی 2- ارزیابی ریسک 3- فعالیت های کنترلی 4- اطلاعات و ارتباطات 5- نظارت ) اجرا کنند . هدف کلی پژوهش حاضر بررسی میزان اثربخشی حسابرسی داخلی در بهبود کنترلهای داخلی شرکت های هلدینگ و شرکت های تابعه بنیاد مستضغفان انقلاب اسلامی می باشد . پژوهش حاضر از نوع پژوهش های توصیفی واستنباطی بوده و به همین منظورکل شرکت ها ی جامعه آماری که مجموعا 159 شرکت می باشد مورد مطالعه قرار گرفت و به هریک از شرکت ها یک نمونه پرسشنامه ارسال شدکه از این تعداد 134پرسشنامه توسط خبرگان مدیران و افراد متخصص حرفه ای تکمیل شده است. برای گردآوری اطلاعات از ابزار پرسشنامه حاوی20سوال چهار گزینه ای و همچنین برای تجزیه و تحلیل داده ها نیز از روشهای آمار توصیفی و استنباطی استفاده شده است به این صورت که در بخش آمار توصیفی از جداول و نمودارها برای نمایش بهتر اطلاعات استفاده شده است و در بخش آمار استنباطی بوسیله آزمون t-test) t) درسطح اطمینان 95% فرضیه های پژوهش در بوته آزمایش قرار گرفته است . نتایج و یافته های پژوهش نشان می دهد که اثر بخشی واحد حسابرسی داخلی از لحاظ افزایش کارائی عملیات ، قابل اعتماد بودن گزارش دهی مالی ، رعایت قوانین و مقررات ، بی طرفی و بهبود عملکرد کنترل های داخلی و غیره با انجام خدمات مشاوره ای و ارائه خدمات اطمینان بخشی در سطح بسیار قابل قبول در شرکتهای تابعه بنیاد مستضعفان انقلاب اسلامی از نظر خبرگان مدیران و افراد متخصص اثر بخش بوده و تأثیر معنی داری داشته است .