گردو از محصولات مهم خشکباری در جهان است و استان های آذربایجان شرقی و غربی در ایران از مناطق مهم تولید گردو می باشند. سالانه خسارات زیادی از طریق آفات و بیماری به این محصول وارد می-شود که یکی از مهمترین بیماریها، بیماری لکه سیاه یا سوختگی باکتریایی گردو است. باکتری عامل بیماری xanthomonas arboricola pv. juglandis( xaj) می باشد که داخل جوانه ها و سایر قسمت های هوایی گیاه حتی بدون آنکه علائمی از بیماری ایجاد نماید به سر می برد و به راحتی از طریق اندام های گیاهی منتقل می گردد. در حال حاضر شناسایی گیاه آلوده به بیماری و نیز باکتری عامل آن به روش های سنتی جداسازی باکتری از بافت گیاهی و انجام آزمون های بیوشیمیایی لازم انجام می شود که وقت گیر و غیر قابل اعتماد می باشد. هدف از این تحقیق که برای اولین بار در استانهای آذربایجان شرقی و غربی انجام می-گرفت ردیابی و شناسایی عامل بلایت باکتریایی گردو در این دو استان بود. برای انجام این تحقیق، اواسط بهار و اوایل تابستان سال 1391 از باغ های گردوی برخی شهرهای این دو استان به صورت تصادفی نمونه گیری انجام شد و به آزمایشگاه باکتری شناسی دانشگاه زنجان منتقل گردید. نمونه ها براساس روش های معمول، جداسازی و براساس خصوصیات مورفولوژیک و آزمون های بیوشیمیایی به عنوان باکتری xaj تشخیص اولیه داده شدند. جهت شناسایی دقیق تر جدایه ها از آزمون های مبتنی بر واکنشهای زنجیره ای پلیمراز استفاده شد. که برای اینکار از قطعه bp320 که در تحقیق قبلی(زاده محمد ومعرفت، 1390) با شماره دسترسی jn859042 در بانک ژن ثبت شده بود استفاده گردید. پس از مقایسه توالی قطعه با توالی های موجود در genbank، دو پرایمر f و r2 طراحی گردید. پرایمرهای طراحی شده توانستند قطعه bp 320 موردنظر از ژنوم باکتری عامل بیماری را تکثیر نماید. نتایج pcr برای همه جدایه های جداسازی شده در این تحقیق و اخذ شده از کلکسیون باکتری شناسی دانشگاه زنجان مثبت نیز بود.