هدف این پژوهش، بررسی حق الزحمه ی حسابرسی و اندازه ی موسسه ی حسابرسی در شرکت های خانوادگی و غیرخانوادگی پذیرفته شده در بورس اوراق بهادار تهران می باشد. دوره ی زمانی مورد بررسی سال های 1384 تا 1390 و نمونه ی انتخابی شامل 35 شرکت خانوادگی و 64 شرکت غیرخانوادگی است. برای آزمون فرضیه های این پژوهش از روش های پنل معمولی و پنل لاجیت استفاده شده است. نتایج این پژوهش نشان داد که تفاوت معناداری در مبلغ حق الزحمه ی حسابرسی در شرکت های خانوادگی و غیرخانوادگی وجود ندارد. همچنین بین درصد مالکیت خانوادگی با حق الزحمه ی حسابرسی رابطه ی معناداری مشاهده نشد. اما نتایج نشان داد که شرکت های خانوادگی در مقایسه با شرکت های غیرخانوادگی، به احتمال کمتری از سازمان حسابرسی استفاده می کنند. همچنین نتایج بیان کرد که در شرکت های خانوادگی، با افزایش درصد مالکیت خانوادگی، احتمال انتخاب سازمان حسابرسی کاهش می یابد.