نتایج بررسی صفات کیفی نشان داد افزایش نمک های محلول در آب آبیاری تا سطح 180/4 دسی زیمنس بر متر منجر به افزایش انباشت سدیم و محتوای خاکستر دانه زیره سبز شد. شوری آب آبیاری با ایجاد اختلال در جذب یون های فسفر، پتاسیم، کلسیم و منیزیم و کاهش فعالیت یونی آن ها در خاک، غلظت آن ها را در بافت گیاهان کاهش داد. بررسی میانگین درصد ماده آلی و پروتئین دانه نیز نشان از کاهش با افزایش هدایت الکتریکی آب آبیاری داشت. کاربرد کود به ویژه سیستم کوددهی تلفیقی در بهبود صفات کیفی موثر واقع شد و بیشترین غلظت یون های پتاسیم، کلسیم و منیزیم و محتوای پروتئین دانه از تیمار تغذیه تلفیقی به دست آمد. در این تحقیق بالاترین درصد ماده آلی، فسفر و بیشترین کاهش در محتوای سدیم دانه با کاربرد کود شیمیایی کامل به نسبت 80:40:30 کیلوگرم در هکتار حاصل شد اما بین این تیمار و سیستم تلفیق کودی تفاوت معنی داری وجود نداشت. اختلاف تیمارهای کود شیمیایی و دامی بر درصد خاکستر دانه معنی دار نبود اما ورود سدیم بیش از حد باعث افزایش درصد خاکستر گیاهان شاهد گردید.