پیوند هالوژنی، برهمکنشی است که بین یک هالید (x) در یک مولکول (r?x) و یک جایگاه غنی از الکترون در نزدیکی باز لوئیس(y?r’) اتفاق می افتد. پیوند های هیدروژنی و هالوژنی خصوصیات مشابهی دارند. انرژی پیوند های هالوژنی مجزا ( exb) در آنالوگ های جفت باز های dna ( a-x-t، g-x-c) با استفاده از مقادیر چگالی الکترونی در نقاط بحرانی پیوند ها (bcp) بدست آمده از روش اتم ها در مولکول ها (aim) در سطحb3lyp/ 6-31g* محاسبه شده است. انرژی های بدست آمده با ویژگی های ساختاری از قبیل طول پیوند، طول پیوند نرمال و زاویه ی پیوندی و هم چنین سایر داده های مربوط به aim(انرژی چگالی الکترونی، انرژی پتانسیل و انرژی جنبشی) و نتایج حاصل از آنالیز اوربیتال پیوندی طبیعی ( nbo) در توافق خوبی می باشند.