در محیط پویای کسب و کار امروزی، داشتن اطلاعات کافی برای انجام سرمایه گذاری در بورس اوراق بهادار الزامی به نظر می رسد. ارزیابی عملکرد مالی صنایع، بخشی از این اطلاعات را فراهم می سازد. اهداف کلی این پژوهش عبارتند از: (1) ارزیابی عملکرد مالی صنایع با استفاده از تحلیل پوششی داده ها به دو شیوه معمولی و بوت استرپ؛ (2) مقایسه نتایج حاصل از این دو روش؛ و (3) تحلیل حساسیت نمره های کارایی. در این پژوهش از معیارهای حسابداری، بازار و ترکیبی حسابداری و بازار، برای ارزیابی عملکرد مالی استفاده شده است. در راستای تحقق اهداف پژوهش، 15 فرضیه تدوین و آزمون گردیده است. نمونه آماری پژوهش شامل 18 صنعت پذیرفته شده در بورس اوراق بهادار تهران طی دوره زمانی نه ساله 1390-1382 است. نتایج حاصل از آزمون فرضیه های پژوهش نشان می دهد که بین نمره های کارایی محاسبه شده به دو روش معمولی و بوت استرپ، تفاوت معناداری وجود دارد، و استفاده از فن بوت استرپ برای اصلاح روش تحلیل پوششی داده ها ضروری به نظر می رسد. علاوه بر این، تفاوت معناداری بین نمره های کارایی حسابداری، بازار و ترکیبی وجود دارد. در آخر، باید به این یافته اشاره شود که با کاهش همبستگی بین متغیرهای استفاده شده در تحلیل پوششی داده ها حساسیت نمره های کارایی نسبت به ورود و خروج متغیرها افزایش می یابد، و این حساسیت با اصلاح نمره های کارایی افزایش می یابد.