فرایندهای جداسازی در کروماتوگرافی به طور کلی شامل انواع مختلفی از جداسازی های فیزیکی آنالیت ها بر پایه امیال ترکیبی متفاوتشان با فازهای ساکنن و یا جریان متحرک مایع و یا گاز حامل می باشد. سیستم های مدلسازی شده زیادی برای پیش بینی رفتارهای جداسازی کروماتوگرافی و مدل دینامیکی رفتار مولکول حلال آنالیت ها و فازهای ساکن ومتحرک توسط محققان ایجاد شده است. ایجاد یک مدل محاسباتی بر مبنای تیوری برای پیش بینی جداسازی و بازداری های در کروماتوگرافی به ما این امکان رامی دهد که رفتار کروماتوگرافی را بری سیستم های آشفته و دارای اختلال که به سادگی از راه های عملی قابل تکثیر نیستند پیش بینی کنیم. برای انجام ای کار اتوماسیون سلولی می توان به عنوان یک سیستم محاسباتی مفید واقع شود. کار انجام شده دراین رساله شبیه سازی فرایند جداسازی کروماتوگرافی گازی به وسیله اتوماسیون سلولی می باشد. مدل در نظر گرفته شده در این کار شامل دو فرایند کلیدی کروماتوگرافی گاز-جامد می باشد: i) حرکت تصادفی مولکول های آنالیت در فاز متحرک گازی که شامل پدیده های پخش و حرکت مولکول ها در جریان گاز می باشند. ii) پدیده جدب و واجب تصادفی مولکول روی سطح فاز ساکن در مدل ایجاد شده در این رساله از شبکه های دو بعدی مربعی به ابعاد 6000×50 برای نشان دادن ستون کروماتوگرافی استفاده شده است. بررسی نتایج به دست آمده از این الگوی دو بعدی برای شبکه هایی به ابعاد متفاوت تعداد نمونه های متفاوت غلظت ابتدایی متفاوت گونه ها و تعداد مراحل زمانی مختلف نشان می دهد که مدل ایجاد شده به خوبی با داده های تجربی در انطباق می باشد. به عبارت دیگر اتوماسیون سلولی بیان شده در اینجا به خوبی قادر به توصیف مدل دینامیکی رفتار مولکول ها در یک فرایند جداسازی در ستون کروماتوگرافی می باشد.