سقط جنین در گاوهای شیری عموماً به از بین رفتن جنین در بین روزهای 42 تا 260 آبستنی اطلاق می شود. عوامل ایجادکننده سقط به دو بخش عفونی و غیر عفونی تقسیم میشوند. از میان عوامل عفونی مرتبط با سقط جنین در گله های گاو شیری، میتوان به تک یاخته نئوسپورا کانینوم اشاره کرد .این مطالعه بر روی جنین های سقط شده ارجاعی به قطب علمی مطالعه سقط جنین و مرگ ومیر نوزاد نشخوار کننده دانشکده دامپزشکی مشهد انجام پذیرفت. جهت تعیین و بررسی آلودگی نئوسپورا در مغز جنین های سقطی گاوهای شیری از روش pcr استفاده گردید. سپس از مغز جنین های سقطی با واکنش مثبت در تست pcr و به تعداد برابر از نمونه های منفی، برداشت و جهت تثبیت در محلول فرمالین بافره 10 درصد قرار داده شد. پس از طی مراحل آماده سازی و تهیه بلوکهای پارافینی، مقاطع بافتی به ضخامت 5 میکرون تهیه گردید و به روش هماتوکسیلین- ائوزین رنگ آمیزی شدند. پس از بررسی میکروسکوپی هر یک از نمونه های بافتی، وجود ، نوع ، ماهیت و انتشار ضایعات تعیین گردید. همچنین به منظور شناخت عوامل خطر ساز و سایر موارد مرتبط با سقط در گله های گاو شیری و ارزیابی هر یک از آنها بر اساس آزمایش pcr در استان های مختلف کشور طی سال های 1388 تا 1392، آنالیز و محاسبات توسط نرم افزار آنالیز آماری sas (نسخه 9.2) بر روی فاکتور های مورد بررسی انجام پذیرفت. از مجموع 395 نمونه بررسی شده به روش pcr، تعداد 179 نمونه ( 45%) مثبت گزارش گردید . از این تعداد ، تنها 52 نمونه کیفیت لازم را جهت بررسی به روش هیستوپاتولوژی داشتند که به همراه 52 نمونه ی با واکنش منفی در روش pcr مورد مطالعه قرار گرفتند. از بین نمونه های مثبت، تنها در 16 مورد ضایعات آنسفالیت غیر چرکی به عنوان ضایعه اصلی گزارش گردید. آنالیز آماری رابطه معنی داری را میان آنسفالیت غیر چرکی به عنوان یافته ای جهت تشخیص پاتولوژیک بیماری و نتایج بدست آمده از روش pcr تایید نمود. ((p<0.05. در این مطالعه ارتباط آماری معنا داری بین سن مادر، تعداد شکم زایش، اندازه گله، میزان تولید شیر، ابتلا به سایر بیماری ها، فصل، وضعیت ظاهری جنین و نتایج بدست آمده از آزمایش pcr با استفاده از آزمون آماری مشاهده نگردید (p > 0.05). اما بین سن جنین های سقط شده، صفت مرده زایی و نتایج بدست آمده از آزمایش pcr، ارتباط آماری معنا داری، بوسیله آزمون آماری مشاهده شد(p < 0.05). نتایج این مطالعه، ضرورت بررسی بیشتر جهت برنامه ریزی کنترل و پیشگیری سقط جنین نئوسپورایی را در گله های گاو شیری مشخص می نماید