دما و شوری زیاد در آب های خلیج فارس و همچنین ورود آب های رودخانه ای، شرایط مساعدی را برای ظهور پدیده کشند قرمز در این منطقه فراهم آورده است. از این رو در سال های گذشته شاهد وقوع این پدیده به طور متناوب بوده ایم. در واقع کشند قرمز، در نتیجه رشد سریع جلبک ها ایجاد می شود، اما همچنان دلیل اصلی وقوع این پدیده مشخص نیست. از این پدیده بیولوژیکی به عنوان آلودگی دریایی یاد می شود و تاثیرات مخربی بر زندگی ساکنین منطقه و حیات جانوران دریایی دارد. به همین خاطر شناختن سرچشمه و شیوه گسترش کشند قرمز در خلیج فارس، می تواند به ما در پاک سازی و پیش گیری کمک شایانی کند. به کارگیری مدل های عددی، روش تازه ای است که برای این منظور به کار می رود. در این تحقیق شیوه توزیع این آلودگی را در شرایط و زمان های مختلف توسط مدل سه بعدی هیدرودینامیکی شبیه سازی می شود. به این منظور از مدل کوهرنس برای شبیه سازی پخش شدگی کشند قرمز و سرچشمه های آن استفاده شده است.چنین مدلی قابلیت ردیابی لاگرانژی و پخش آلودگی را با به کارگیری مختصات سیگما در جهت قائم و مختصات دکارتی در جهت افقی قرار دارد. نتایج به دست آمده از مدل نشان می دهد که سواحل بندرعباس و قشم بیشترین احتمال آلودگی را دارد. همچنین پیش بینی می شود که سرچشمه کشند قرمز در دریای عمان و تنگه هرمز قرار داشته باشد که از طریق تنگه هرمز وارد خلیج فارس می شود و سپس تحت تأثیر چرخه پادساعتگرد نخست خلیج در امتداد سواحل ایران به سمت شمال حرکت کرده و سپس به سواحل کویت و امارات متحده عربی می رسد. همچنین نتایج مدل نشان می دهد که پس از گذشت شش ماه از شروع پدیده (آگوست)، کشند قرمز به سواحل ایران می رسد. نتایج حاصل از شبیه سازی مدل در مورد نحوه گسترش کشند قرمز در خلیج فارس با شواهد و داده های تجربی مطابقت خوبی دارد و از الگوی جریانات موجود پیروی می کند.