پیچیدگی شبکه های زیستی و تعداد زیاد ژ ن ها در مجموعه داده های ریز آرایه منجر به چالش های فراوان در زمینه تحلیل داده های بیان ژنی شده است. الگوریتم های خوشه بندی که ژن های مشابه یکدیگر را به هدف تحلیل عملکرد ژن ها گروه بندی می نماید اولین قدم برای رویارویی با این چالش ها می باشد. بطور کلی روش های خوشه بندی فازی برای تحلیل داده های بیان ژنی مناسب تر می باشند زیرا گروه های زیستی به طور ذاتی دارای هم پوشانی بوده و به میزان قابل توجهی نویز در آن ها مشاهده می شود. در همین راستا در این رساله از الگوریتم تولید قوانین فازی جهت خوشه بندی داده های بیان ژنی استفاده شده است که به صورت خودکار خوشه های نهفته در داده های بیان ژنی را بدون نیاز به دانش قبلی کشف کرده و با تولید قوانین فازی قابل تفسیر خوشه های کشف شده را به صورت قابل فهم برای انسان نشان می دهد. در پایان نیز میزان دقت الگوریتم پیشنهادی بر روی چند مجموعه داده ریز آرایه توسط چند معیار درستی بررسی شده و با چند روش خوشه بندی فازی شناخته شده مقایسه گردیده است.