هیدروکربن های آروماتیک چند حلقه ای (pahs) یک گروه متنوع از ترکیبات آلی هستند که به علت خصوصیاتی همچون سمیت، سرطانزایی و ماندگاری بالا به عنوان یکی از آلاینده های مهم محیطی شناخته شده اند. با توجه به مشکلات و محدودیت هایی که در روش های فیزیکی و شیمیایی برای حذف این آلاینده ها از محیط وجود دارد، روش تجزیه زیستی (biodegradation) با استفاده از میکروارگانیسم ها فرایندی سالم، موثر و اقتصادی جهت حذف pah ها می باشد. در این مطالعه سه ترکیب نفتالن، فنانترن و پیرن به عنوان مدل برای مطالعه تجزیه زیستی ترکیبات pah انتخاب شد. هدف اصلی ما در این تحقیق غربالگری و شناسایی مولکولی باکتری های بومی تجزیه کننده این ترکیبات می باشد. به این منظور از خاک های مناطق آلوده به ترکیبات نفتی (مانند اطراف پالایشگاه تهران و اطراف لوله های انتقال نفت اهواز) به عنوان منبع جداسازی باکتری ها و از محیط پایه معدنی bushnell-haas broth حاوی پیرن برای غنی سازی استفاده شد. تمام جدایه های موثر در مرحله اول، با استفاده از روش های مورفولوژیکی و بیوشیمیایی در حد جنس شناسایی شدند. سپس در محیط کشتbh جامد به همراه غلظت های مختلفpah ها کشت داده شدند که برحسب میزان رشد و قطر هاله، دو جدایه به عنوان سویه های برتر انتخاب شد. به منظور شناسایی دقیق مولکولی، تکثیر و تعیین توالی 16s rdna سویه های برتر انجام شد. سپس میزان رشد این جدایه ها در محیطbh مایع حاوی مخلوطpah ها به عنوان تنها منبع کربن بررسی شده و با نمونه شاهد فاقد منبع کربن مقایسه گردید. مقدار pah باقی مانده در محیط نیز با استفاده از دستگاه (gc/fid) تعیین شد. نتایج نشان داد که جدایه های برتر شناسایی شده متعلق به جنس pseudoxanthomonas sp. و sp. ralstonia می باشند که نه تنها به pah ها مقاوم اند بلکه توانایی رشد در حضور pah و استفاده از آن به عنوان تنها منبع کربن و انرژی را دارند. بنابراین می توان از آنها پس از بررسی در سطح پایلوت و تعیین فرمولاسیون سویه ها، جهت پاکسازی زیستی (bioremediation)استفاده نمود.