یکی از اصلی ترین اهداف این پایان نامه تولید اطلاعات دقیق از بنا در راستای شناخت وضعیت موجود؛ عارضه ها و راهکارهای مرمتی آن می باشد. به همان اندازه که معماری ایرانی و معماری سایر ملل روزگاران قدیم بر معماری اسلامی تأثیرگذار بوده اند؛ به همان اندازه نیز این معماریها به فراخور فضاهای خود از مفاهیم اسلامی و معنای مسجد به مفهوم واقعی آن تأثیر گرفته اند. اگرچه سیر تحول این مساجد در هر مکانی متأثر از ویژگیهای خاصی بوده است اما در نهایت دارای اصول یکسانی است. در مطالعه مسجد جامع نائین به عنوان نمونه موردی این پروژه سعی شد تا با شناخت دقیق و علمی وضع موجود بنا به ارائه راهکار مرمتی مناسب که تلفیقی است از راهکارهای سنتی مرمت با تکنولوژی نوین پرداخته شده است.