بی‏مهرگان نقش زیادی در چرخه بازسازی مواد مغذی در تالاب گمیشان دارند. در این تحقیق، مرزبندی این تالاب بر اساس ارتباط فاکتورهای محیطی با موجودات کفزی، مورد بررسی قرار گرفت. نمونه برداری به روش خوشه ای سیستماتیک در دو فصل بهار و تابستان در 4 ایستگاه (هر ایستگاه در 4 بخش، پیشروی، ساحلی، میانی و نزدیک به دریا) با استفاده از نمونه‏بردار اکمن گرب انجام گردید. در این بررسی، 10 خانواده از کفزیان شناسایی شدند که بیشترین فراوانی در همه ایستگاه‏ها مربوط به خانواده pyrgulidae (از شکم پایان) و کمترین فراوانی مربوط به خانواده nereidae (از پرتاران) بود. شاخص های بررسی سلامت زیستی، آلودگی زیادی را در تالاب گمیشان نشان دادند. مقایسه تصاویر ماهواره ای بر اساس سنجش از دور، به خوبی پیشروی آب در فصل تابستان را تأیید نمود، به طوری که فاصله بین خط‏های ساحلی در دو فصل بهار و تابستان در بیش‏ترین حالت برابر با 369 متر به دست آمد. نقشه مرزبندی تالاب گمیشان در محیط نرم افزار gis با استفاده از معادله رگرسیونی بین حضور خانواده های بزرگ بی مهره کفزی با عوامل محیطی در دو فصل بهار و تابستان به دست آمد. چنین اطلاعاتی جهت برنامه‏ریزی و مدیریت کارآمد این اکوسیستم تالابی مهم می تواند مفید و ارزشمند باشد.