اثرات نامطلوب آفت کش های شیمیایی باعث شده که طی چندین دهه اخیر، کنترل زیستی به عنوان یک راهکار مناسب برای کنترل آفات مورد توجه زیادی باشد. کاربرد موفقیت آمیز عوامل کنترل بیولوژیک و استقرار مناسب جمعیت های آنها در مناطق مختلف نیازمند آگاهی از جنبه های مختلف زیستی این گونه ها است. کفشدوزک cryptolaemus montrouzieri اصلی ترین دشمن طبیعی شپشک های آردآلود در باغ های مرکبات و چایکاری های استان مازندران است. این تحقیق با هدف توصیف ساختار و تنوع ژنتیکی اکوتیپ های مختلف این گونه در هشت جمعیت طبیعی و دو جمعیت پرورش تجارتی آن با استفاده از نشانگر rapd و توالی یابی ژن سیتوکروم اکسیدازi انجام گردید. در آزمون نشانگر های rapd از 22 آغارگر ده نوکلئوتیدی (opa01-10, opb01-10, opw01-2) استفاده شد. میزان تشابه ژنتیکی میان جمعیت ها بین 48/0 تا 78/0 بدست آمد. با گروه بندی جمعیت ها با روش upgma با استفاده از نرم افزار ntsys-pc جمعیت های مورد بررسی در دو گروه طبقه بندی شدند. در توالی یابی ژن coi، قطعه ای به طول bp 710 تکثیر شد. قطعات تکثیر شده توالی یابی شده و توسط نرم افزارهای dnasp و mega5 مورد ارزیابی قرار گرفتند. میزان تفاوت ژنتیکی بین صفر تا 016/0 بدست آمد. با توجه به تبارنمای بدست آمده با استفاده از روش neighbour joining، ده جمعیت مورد مطالعه در دو شاخه فیلوژنتیکی به صورت جداگانه قرار گرفتند. نتایج بدست آمده در بررسی تنوع ژنتیکی این گونه با استفاده از هر دو روش rapd و توالی یابی ژن coi مشابه بود و نشان داد که جمعیت های مورد مطالعه از یکدیگر جدا نبوده و جریان ژنی زیادی بین آنها وجود دارد.