رشد روز افزون جمعیت، نیاز به تولیدات کشاورزی و مواد غذایی را افزایش داده و زمینه گسترش فعالیتهای کشاورزی را فراهم آورده است. این افزایش تولید دارای عوارض زیست محیطی فراوان از جمله آبیاری بیشتر و مصرف بیشتر سموم شیمیایی بوده که در نتیجه باعث شستشو و جابجایی این ترکیبات به لایه های مختلف خاک و آبهای زیرزمینی می شود. با گذشت زمان موارد مختلفی از جمله مقاومت آفات به سموم شیمیایی، بقایای سموم در محصولات کشاورزی، آلودگی محیط زیست و تهدید سلامت انسان ها توجه محققان را به استفاده از سموم کم خطر و یا استفاده از ترکیبات گیاهی مختلف به عنوان جایگزین سموم شیمیایی جلب کرده است. استخراج متابولیت‏های گیاهی به‏روش عصاره‏گیری و بررسی فعالیت ضد میکروبی آنها، راهی برای شناسایی گیاهان دارویی با اثر ضدمیکروبی جهت دست‏ورزی‏های ژنتیکی و تولید سموم ارگانیک گیاهی می‏باشد. باتوجه به تنوع بالای فلورگیاهی ایران (7500 گونه) و کاربرد دارویی تعداد زیادی از این گیاهان در طب سنتی، بررسی ویژگی‏های ضدمیکروبی این گیاهان ضروری است. به همین منظور در این مطالعه در ابتدا عصاره گیاهان اسطوخودوس، اکالیپتوس، اکلیل کوهی، انجیلی، پنج انگشت، جگن، زالزالک ، زولنگ ، سرو زربین، سروخمره ای، سروکوهی، شاه پسند، کنگر گورخری، گاوزبان وحشی، گون، علف باغی، مامیران، موره ، نسترن کوهی و قاصد بهار با استفاده از حلال متانولی و کلروفرمی استخراج گردید و بر روی چهارگونه باکتری بیماریزای گیاهی شامل: rathayibacter tritici، erwinia amylovora ، pesudomonas syringae pv. syringae، xanthomonas campestris و باکتری escherichia coli به عنوان شاهد، مورد آزمایش قرار گرفتند. بررسی فعالیت ضد باکتریایی عصاره های گیاهان مورد مطالعه با استفاده از روش دیسک کاغذی انجام شد و نتایج در قالب طرح فاکتوریل برپایه کاملا تصادفی با نرم افزارminitab تجزیه گردید. در مرحله بعد عصاره متانولی گیاهانی که خاصیت ضدمیکروبی نشان داده بودند به دستگاه gc-ms تزریق شد و ترکیبات تشکیل دهنده گیاهان بررسی شدند.