نام پژوهشگر: حمید رضا کربلایی حیدری

بررسی میزان بیان آنزیم دایسر در نواحی in situ carcinoma در مقایسه با مناطق in vasive carcinoma در سرطان پستان
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شیراز - دانشکده علوم 1390
  نرجس طبیبی   حمید رضا کربلایی حیدری

خلاصه : کارسینوم تهاجمی سینه پستان علت مرگ و میر حاصل از سرطان خانم ها در بسیاری از کشورها می باشد. این کارسینوم بدنبال کارسینوم در محل ایجاد می شود. در کارسینوم در محل سلول های توموری هنوز نتوانسته اند که از غشاء پایه عبور کنند. در عبور از مرحله کارسینوم در محل به مرحله تهاجمی، سلولهای سرطانی تغییرات مولکولی بسیاری پیدا میکنند که هنوز علت عده ای از آنها مشخص نشده است. در این مطالعه ما بررسی کردیم که چگونه بیان یکی از اصلی ترین اجزاء سیستم ماشین mirna ، پروتئین دایسر (dicer) ، در زمانی که سلول های توموری به استروما حمله می کنند، تغییر می کند. موارد و روش کار : تعداد 20 نمونه از کارسینوم تهاجمی که دارای بخش های توموری در محل نیز بودند از آرشیو پاتولوژی بیمارستانهای وابسته دانشگاه علوم پزشکی شیراز انتخاب گردیدند. برای هر نمونه از بهترین بلوک پارافینه چندین برش 5 میکرونی بریده شد و روی اسلاید مخصوص دستگاه برش با لیزر (laser micro dissection) قرار داده شد و بخش های در محل (in situ) وتهاجمی ( in vasive) جداگانه برش داده شده و در تیوبهای جدا و مخصوص نگهداری شدند. از آنها rna استخراج شده و cdna ساخته شد و با کمک پرایمرهای مناسب برای ردیابی همزمان ژن dicer (ژن مورد نظر) و ژن rrna ( ژن مرجع ) در تیوبهای جداگانه و با کمک syber green i و تکنیک real time pcr تکثیر انجام شد و میزان ژن دایسر در دو قسمت " در محل" و "تهاجمی " با روش مقایسه کمی نسبی اندازه گیری شد. بازده تکثیر برای هر دو واکنش 95-100% می بود. نتایج : با استفاده از روش ct?? به عنوان متد برتر برای اندازه گیری کمی نسبی متوجه می شویم که در تمام نمونه ها بجز یکی ، بیان دایسر در بخش های تهاجمی در مقایسه با بخش های کارسینوم در محل افزایش یافته است. این تفاوت از نظر آماری معنی دار بود. (سطح معنی داری p=0.001 ) بحث : بیان آنزیم دایسر در بخش های تهاجمی از کارسینوم سینه در مقایسه با بخش های کارسینوم در محل بیشتر می باشد. البته هنوز اهمیت این اختلاف مشخص نشده است. کلید واژگان : دایسر ، سرطان سینه ، سرطان در محل

جدا سازی باکتری های تولید کننده پلی هیدروکسیآلکانوات (بیو پلاستیک) و بررسی پارامترهای موثر در تجمع آن
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شیراز - دانشکده علوم 1392
  محمد علی عوض آقایی   حمید رضا کربلایی حیدری

در تحقیق حاضر تلاش برای جداسازی یک سویه باکتریایی با توانایی تولید پلی هیدروکسی بوتیرات از نمونه های مختلف محیطی صورت گرفت. با استفاده از رنگ آمیزی کلونی با سودان سیاه، سویه ی ma1392 به عنوان باکتری تولید کننده پلی هیدروکسی بوتیرات انتخاب شد. بر اساس ویژگی های مورفولوژی و فیزیولوژی و همچنین با مقایسه توالی dna ریبوزومی s16 با توالی های dna ریبوزومی s16 موجود درداده پایگاهncbi مشخص شد که این سویه باکتریایی متعلق به جنس bacillus می باشد و تحت نام bacillus sp. strain ma1392 در genbank معرفی گردید. در آزمایشات تک فاکتوری انجام شده بهینه ترین منابع کربن و نیتروژن به ترتیب نشاسته 1 درصد و آمونیوم سولفات 05/0 درصد انتخاب شدند. با استفاده از نرم افزار design expertمنوی 2-level factorial، اثر فاکتورهای مختلف بررسی و فاکتورهای ph، مدت زمان انکوباسیون و غلظت فسفات موثر شناخته شدند. از فاکتورهای موثر فوق برای مطالعات rsmاستفاده شد.نتایج نشان داد که بالاترین میزان تولید phb (242/0 گرم در لیتر، 55/16 درصد نسبت به وزن خشک سلولی) توسط باکتری bacillus sp. ma1392 در محیط کشت با ترکیبات نشاسته 1 درصد، آمونیوم سولفات 05/0 درصد، 0/7ph~، زمان انکوباسیون 48 ساعت و دمای 30 درجه سانتیگراد حاصل میگردد.