چکیده مطالعه حاضر در رودخانه بابلرود که یکی از رودخانه های منشاء گرفته از رشته کوه های البرز است در فاصله زمانی فروردین تا شهریور 1391 به انجام رسیده است. نمونه برداری دیاتومه های اپی لیتون در 5 ایستگاه از سطح سنگ و رسوبات رودخانه به صورت ماهیانه انجام گرفت. نمونه ها در محل توسط فرمالین 4% فیکس شدند. شناسایی و شمارش به کمک میکروسکوپ نوری معمولی و اینورت و کلید های تخصصی انجام گرفت. در این تحقیق ، عوامل فیزیکوشیمیایی دما، ph، ec، نیترات و فسفات اندازه گیری شد. در این مطالعه در مجموع 70 گونه دیاتومه متعلق به 20 جنس شناسایی گردید. جنس های navicula، nitzschia، achnanthes، cymbella و gomphonema به ترتیب با داشتن 12، 9، 9، 8 و 6 گونه از تنوع زیادی در طول رودخانه برخوردار بودند. برای اثبات و تفسیر ارتباط شاخص های زیستی gdi و تنوع زیستی شانون - واینر با پارامتر های فیزیکوشیمایی از آزمون اختلاف میانگین anova، تست tuky و ضریب همبستگی پیرسون استفاده شد. همزمان با مطالعات جلبکی، نمونه های گیاهی آبزی و حاشیه ی رودخانه، جمع آوری و به طریق علمی خشک و پرس گردیده و با کلید های تخصصی شناسایی شد و شکل زیستی و کوروتیپ آن ها مشخص گردید. در این مطالعه 75 گونه در61 جنس و 33 تیره گیاهی جمع آوری و شناسایی شده است. از 33 تیره گیاهی، تیره های گندمیان (poaceae) با 10 گونه (3/13 درصد) و کاسنی (asteraceae) با 9 گونه (12 درصد) بترتیب غنی ترین تیره های گیاهی منطقه مورد مطالعه می باشند. بررسی اشکال زیستی گونه ها نشان می دهد که بیشترین تعداد مربوط به تروفیت ها (7/42 درصد)، هلوفیت (24درصد) و همی کریپتوفیت ها (3/17 درصد) می باشد. از نظر کورولوژیکی 7/58 درصد گیاهان چند ناحیه ای (pl) هستند.