شناخت عوامل موثر بر هزینه های نمایندگی و ساختار سرمایه شرکت به دلیل تأثیری که بر ارزش شرکت می گذارند از اهمیت ویژه ای برخوردار است. بنابراین، هدف این تحقیق بررسی رابطه متقابل بین هزینه های نمایندگی جریان نقد آزاد و سطح بدهی شرکت ها است. همچنین، تأثیر ساختار مالکیت بر هزینه های نمایندگی جریان نقد آزاد و ویژگی های شرکت بر بدهی مورد بررسی قرار گرفته است. در این تحقیق علاوه بر بدهی، از متغیر های مالکیت مدیریت، مالکیت نهادی و تمرکز مالکیت به عنوان متغیر های تأثیرگذار بر هزینه های نمایندگی جریان نقد آزاد استفاده شده است. از این رو، داده های مربوط به 113 شرکت های پذیرفته شده در بورس اوراق بهادار تهران برای دوره زمانی 1383-1389 با استفاده از داده های تلفیقی در چارچوب معادلات همزمان به روش حداقل مربعات دو مرحله ای مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفتند. نتایج تحقیق نشان داد که بدهی تأثیر منفی و معنی داری بر هزینه های نمایندگی جریان نقد آزاد دارد. همچنین، هزینه های نمایندگی جریان نقد آزاد موجب استفاده بیشتر از بدهی در ساختار سرمایه شرکت ها شده است. بر اساس سایر نتایج تحقیق، مالکیت مدیریت و مالکیت نهادی تأثیر منفی معنی داری بر هزینه های نمایندگی جریان نقد آزاد دارند اما تمرکز مالکیت موجب افزایش هزینه های نمایندگی شده است. همچنین، بین سود-آوری، اندازه ی شرکت، ریسک و بدهی رابطه منفی و معنی دار و بین قابلیت مشاهده دارایی ها و بدهی رابطه مثبت و معنی داری وجود دارد.