برهمکنش پورفیرازین کاتیونی تتراکیس(n,n,n,n -4,3-تتراپیریدینو) روی(ii) (zn(tmtppa))با پلی نوکلئوتیدهای سنتزی: poly[d(g-c)]2 و poly[d(a-t)]2 و dna غده تیموس گوساله در بافر فسفات 5/7 میلی مولار با ph 2/7 با استفاده از تکنیک های اسپکتروسکوپی جذب نوری و فلورسانس مطالعه شده است. کاهش جذب بیشتر از % 40 در طیف uv-vis پورفیرازین به دلیل برهمکنش با هر دو پلی نوکلئوتیدهای poly[d(g-c)]2 و poly[d(a-t)]2 می باشد که مشابه برهمکنش پورفیرازین با dna می باشد. ثابت های ظاهری پیوند با استفاده از ماکزیمم طیف جذبی پورفیرازین در نوارq در غلظتهای مختلف poly[d(g-c)]2، poly[d(a-t)]2 و dnaبه دست آمد. مقدار k برای poly[d(g-c)]2، poly[d(a-t)]2 و dnaبه ترتیب m-1106×5/2، m-1 106 × 5/2 و m-1105 × 5/2 در دمای 25 درجه سانتی گراد به دست آمد. پارامترهای ترمودینامیکی (?g°,?h° and ?s°)با استفاده از معادله ی وانت هوف در دماهای مختلف تعیین شدند. تغییرات آنتالپی و آنتروپی k j mol-1 14/41 و j mol-1k-1 50/260 برای poly[d(g-c)]2 و k j mol-1 59/53 و j mol-1k-1 46/285 برای dna در دمای 25 درجه سانتی گراد محاسبه گردید. مقادیر آنتروپی و آنتالپی مثبت و بزرگ حاکی از آن است که هر دو نیروهای هیدروفوبیک و الکترواستاتیک در این برهمکنش ها نقش مهمی دارند. خاموشی فلورسانس اتیدیوم برماید dna- به وسیله پورفیرازین بررسی گردید. مقدار ثابت خاموشی (ksv) با استفاده از معادله ی استرن- ولمر به دست آمد. نتایج نشان می دهد که این پورفیرازین در نواحی غنی از پلی نوکلئوتیدهای dna که شامل بازهای آدنین-تیمین و گوانین-سیتوزین هستند، از طریق پیوند بین شیاری برهمکنش ایجاد می نماید.