ایران جزء سرزمین های خشک و نیمه خشک و کم آب به حساب می آید و توزیع مکانی منابع آب نیز در آن یکنواخت نمی باشد. در برخی حوزه ها آب کافی وجود دارد و برخی مناطق با کمبود شدید مواجه است؛و خشکسالی های دوره ای نیز از عوامل تاثیرگذار و تشدیدکننده کم آبی در این مناطق می باشد. از سوی دیگر به دلیل توزیع نامناسب آب، خاک و جمعیت که موجب عدم توزیع یکنواخت زمانی و مکانی منابع و مصارف آبی شده است، انتقال آب از حوزه ای به حوزه دیگر برای برای برقراری این توازن و توزیع همگن تر منابع و نیازها می تواند یکی از مهمترین و موثرترین راه های تامین نیاز آبی در منطقه مقصد باشد.با توجه به وقوع خشکسالی های اخیر و افزایش برداشت ها و مصارف روزافزون و تخلیه پساب ها به رودخانه و همچنین اجرای طرح های انتقال بین حوضه ای آب از سرچشمه های رودخانه های کارون و دز، بررسی کیفیت آب در وضع کنونی و تاثیرات تغییرات دبی جریان بر کیفیت رودخانه کارون امری ضروری به نظر می رسد. بدین منظور در این تحقیق از مدل ریاضی qual2kبرای شبیه سازی کیفی رودخانه کارون در اثر تغییرات میزان آورد در چهار ماه از سال 87 استفاده شده است. و بازه ای به طول 110 کیلومتر از ایستگاه گتوند تا ایستگاه ملاثانی مورد ارزیابی کمی و کیفی قرار گرفت. نتایج شبیه سازی نشان دهنده وضعیت آلوده و نامطلوب رودخانه در ماه های خشک و کم آب است. همچنین با ادامه وضع موجود و اجرا شدن طرح های انتقال آب از سرشاخه ها شاهد وقوع این وضع نامطلوب در بیشتر ماه های سال خواهیم بود که در ماه های خشک و کم آب این وضعیت بحرانی تر خواهد بود.