کاروفیت ها گروهی از جلبک های سبز می باشند که بصورت غوطه ور در رودخانه ها، برکه ها و سایر زیستگاه های آبی راکد و جاری حضور دارند. مهم ترین جنس در این گروه از جلبک ها جنس chara l. می باشد. از آنجا که درکشور ایران نیز زیستگاه های آبی زیادی وجود دارد و در مورد خصوصیات ریخت شناسی، پراکنش و شناسایی اعضای این جنس درزیستگاه های آبی کشور مطالعات کمی صورت گرفته است، لذا در این پژوهش به مطالعه ریخت شناسی و تنوع وراثتی تعدادی از گونه های این جنس پرداخته شده است. بدین منظور، نمونه هایی از زیستگاه های آبی مختلف کشور جمع آوری گردید، بررسی های مورفولوژیک‍‍ی و تشریحی با کمک استریومیکروسکوپ و میکروسکوپ انجام شد. شناسایی نمونه ها طبق کلید های معتبر wood and imahori و moore انجام گردید که در این تحقیق 3 گونه متعلق به این جنس، گونه های chara vulgaris، c. gymnophylla و c. zeylanica شناسایی شدند، که گونه c. zeylanica اولین گزارش از ایران می باشد. سپس از برخی از صفات کلیدی مهم در شناسایی گونه های این جنس تعداد 42 صفت ریخت شناسی کیفی و کمّی مورد مطالعه انتخاب شدند و به منظور تحلیل داده های حاصل، آنالیز خوشه ای با استفاده از ضریب تشابه جاکارد و روش ward و آنالیز مولفه اصلی انجام گردید که نشان داد بسیاری از صفات ریخت-شناختی مورد استفاده در شناسایی گونه ها به ویژه صفات کیفی در تفکیک گونه ها مناسب بودند و نتایج حاصل از این آنالیز ها، سه گونه شناسایی شده از طریق بررسی های مورفولوژیک را تائید نمودند. بعد از مطالعات ریخت شناسی استخراج dna از نمونه ها انجام گرفت و از 10 آغازگر rapd برای مطالعه تنوع ژنتیکی گونه های شناسایی شده استفاده شد که تنها 5 آغازگر rapd به کار برده شده در این تحقیق توانستند به خوبی گونه های این جنس را از هم تفکیک کنند و پلی مورفیسم چندانی درون گونه های این جنس مشاهده نشد. با استفاده از داده های مولکولی دندروگرامی رسم شد که روابط بین گونه ای جنس را مشخص کرد و در تطابق با دندروگرام حاصل از داده های مورفولوژیکی بود و مارکر rapd اعتبار صفات ریخت شناسی انتخاب شده را تایید نمود.