اکینوکوکوس گرانولوزوس دارای 10 سویه g1-g10 می باشد. که هر سویه به میزبان واسط خاصی مربوط می شود. این سویه ها از نظر ریخت شناسی، همه گیری شناسی، درمان و کنترل با هم اختلاف دارند. برای شناسایی سویه ها از روش های مورفولوژیکی و مولکولی زیادی استفاده می شود، که البته استفاده این روش ها با همدیگر برای شناسایی سویه ها اطلاعات قابل قبول تری در رابطه با شتاسایی تنوع در سویه های اکینوکوکوس گرانولوزوس فراهم می کند. هدف اصلی مطالعه ی حاضر بررسی مورفولوژیکی و مولکولی کیست های هیداتید گوسفندان کشتارشده در کشتارگاه مشهد به منظور شناسایی سویه های اکینوکوکوس بود. در این مطالعه اندام های آلوده(کبد و ریه) از کشتارگاه به آزمایشگاه منتقل شدند. پس از استخراج مایع کیست های هیداتید، شاخص های مورفولوژیک قلاب های روستلوم پروتواسکولکس ها با استفاده از عدسی مدرج چشمی اندازه گیری شدند. نتایج بررسی شاخص های مورفولوژیکی قلاب های روستلوم پروتواسکولکس ها شامل: طول کلی قلاب بزرگ3/0±6/23 و طول تیغه ی قلاب بزرگ 5/0±7/11 و طول کلی قلاب کوچک 7/1±3/19 و طول تیغه ی قلاب کوچک 1/1±8 و تعداد کلی قلاب 7/0±7/33 می باشد. در بخش مولکولی این مطالعه بعد از استخراج dnaبا کیت mbst، واکنش pcr بر روی ژن its1 با دو پرایمر egr,egrصورت گرفت. سپس محصول pcr توسط آنزیم bsh1236i مورد هضم آنزیمی قرار گرفت. براساس الگوی باندها(4باند) گونه اکینوکوکوس گرانولوزوس سویه های g1,g2,g3 تشخیص داده شد. و برای تمایز سه سویه از یکدیگر تعیین توالی صورت گرفت. و سویه g1 تشخیص داده شد. نتایج مولکولی با نتایج مورفولوژیکی قلاب های روستلوم کاملأ هماهنگ بود و هر دو نشان دهنده ی تأیید وجود سویه گوسفندی g1در گوسفندان کشتاری مشهد بود. کلمات کلیدی: اکینوکوکوس گرانولوزوس، کیست هیداتید،pcr، گوسفند