شناسایی نشانگرهای ssr پیوسته با ژن های تحمل به خشکی در لاین های موتانت برنج برنج (oryza sativa) منبع اصلی غذای بیش از یک سوم جمعیت جهان است و پس از گندم دومین غله مهم در دنیاست. نواحی اصلی کشت برنج در ایران(مازندران، گیلان) هر ساله با مشکل تنش خشکی به ویژه در اواخر مرحله گلدهی مواجهند. از این رو ایجاد ارقام متحمل به خشکی و کارا در استفاده از آب ضروری به نظر می رسد. از تکنیک موتاسیون (پرتوتابی با اشعه گاما) جهت تأمین تنوع مورد نیاز استفاده شد. استفاده از روشهای سنتی برای شناسایی ارقام متحمل به خشکی به صرف زمان و هزینه زیاد نیازمند است ولی با ایجاد نشانگرهای مولکولی پیوسته با ژن می توان زمان لازم برای فرایند اصلاح را کاهش داد. به این منظور در این تحقیق جهت شناسایی نشانگرهای پیوسته با ژن های مسئول تحمل به خشکی در لاین های موتانت، از 11 جفت آغازگر ssr استفاده شد.در آنالیز مولکولی ارقام شاهد و لاین های موتانت، از 11 جفت آغازگر، شش جفت آغازگرrm470 ،rm205،rm201،rm328،rm303 و rm215 آلل های چندشکل احتمالی مرتبط با ژن های تحمل به تنش خشکی را ایجاد کردند و تعداد 10 آلل چندشکل مرتبط با تحمل به خشکی شناسایی گردید.بر اساس دندروگرام داده های مولکولی حاصل از آغازگرهای اختصاصی ssr استفاده شده در این تحقیق ، نمونه های مورد مطالعه به 12 گروه تقسیم شدند.