در اثر برهمکنش باریکه پرانرژی با ماده، فرایند برانگیختگی و یونیزاسیون اتم ها و بدنبال آن فلورسانس پرتو ایکس مشخصه ایجاد می شود. در برهم کنش باریکه مولکولی پرانرژی با ماده، پدیده های منحصربفرد اثر همسایگی و انفجار کولنی مشاهده شده است. در این پروژه پژوهشی برای مطالعه برهمکنش باریکه مولکولی با ماده، بهره اشعه ایکس مشخصه برهم کنش ناشی از باریکه مولکولی 2h+ با باریکه اتمی +h مقایسه شده است. باریکه یونی اتمی و مولکولی با انرژی های 1 تا mev/amu 4/1 با هدف های cu، mn وal با اعداد اتمی متفاوت برای تابش مورد استفاده قرار گرفته است. در مورد هدف های cu و mn بهره پرتوهای ایکس مشخصه اندازه گیری شده برای باریکه های ورودی اتمی و مولکولی تفاوت قابل ملاحظه ای را نشان نمی دهند. اما برای هدف al، در بهره پرتو ایکس ناشی از باریکه های اتمی و مولکولی اختلاف معنی داری اندازه گیری شده است.