رشد سریع جمعیت و صنعتی شدن جوامع از یک سو و تغییر شرایط اقلیمی از سوی دیگر سبب شده است که مدیریت و برنامه ریزی، استفاده از منابع آب مورد توجه ویژه ای قرار بگیرد. در این میان مدنظر قرار دادن شرایط کیفی در کنار جنبه های کمی به عنوان گامی موثر در توسعه منابع آب تلقی می شود. در این تحقیق روند تغییرات کیفیت آب رودخانه حبله رود متناسب با تغییر شرایط هیدرولوژیک مورد بررسی قرار گرفته است، با توجه به اینکه بخش اعظم نیاز آبی دشت گرمسار از قبیل آب شرب سکنه اطراف رودخانه و آب مصرفی کشاورزی از این رودخانه تامین می شود، بنابراین بررسی شرایط کیفی جریان می تواند حائز اهمیت باشد. در ابتدا شرایط هیدرولوژیکی بلند مدت توسط شاخص بارش استاندارد، در پنج ایستگاه باران سنجی با در نظر گرفتن دوره آماری 36 ساله تعیین شد. استفاده از این شاخص امکان شناسایی دو دوره با بیشترین خشکسالی و دو دوره با کمترین خشکسالی را در تمامی ایستگاه ها فراهم نمود. در ادامه تاثیر شرایط هیدرولوژیکی بر کیفیت آب کشاورزی و شرب با استفاده از روش های ویلکوکس و شولر مورد تحلیل و بررسی قرار گرفته است. نتایج نشان داد که کیفیت آب در سال های کم آبی از وضعیت نامساعدتری برخوردار است. این کاهش کیفیت در وضعیت آب شرب تاثیر چشمگیرتری داشته است. در ادامه به منظور تحلیل روند تغییرات کیفی پارامترهای نیترات و فسفات، مدل سازی رودخانه و سرشاخه های آن با استفاده از نرم افزار qual2kw انجام شد. به منظور حصول اطمینان از عملکرد مناسب این مدل پارامترهای تاثیرگذار در روند شبیه سازی کالیبره و صحت سنجی شدند. نتایج نشان داد که شرایط کیفی رودخانه می تواند متناسب با شرایط هیدرولوژیکی، دوره های خشکسالی و ترسالی و همچنین موقعیت مکانی ایستگاه ها تغییرات عمده ای را داشته باشد.