این تحقیق با هدف شناسایی ژن های القاء شونده و همچنین مکانیسم های احتمالی موثر در پاسخ دفاعی گیاه میزبان سیب زمینی (solanum tuberosum, s. phureja)و غیر میزبان توتون (nicotiana tabacum) در برابر باکتری ralstonia solanacearum انجام شد. ارزیابی فنوتیپی مقاومت ارقام تجاری سیب زمینی در شرایط درون شیشه ای درجات مختلفی از حساسیت، تحمل و مقاومت را نشان داد و همچنین مشخص شد روش درون شیشه ای می تواند بعنوان روشی مطمئن، کم هزینه و سریع برای ارزیابی مقاومت به r. solanacearum بکار رود. در مطالعه بیان افتراقی ژن های سیستم دفاعی، الگو های متفاوتی از cdna-aflp در تعامل دو رقم سیب زمینی مارفونا (حساس) الس (متحمل) و یک ژنوتیپ از گونه مقاوم s. phureja با باکتری r. solanacearum مشاهده شد. در مجموع با استفاده از هشت ترکیب آغازگری 2820 cdna تولید شد که از بین آنها 206 قطعه بیان متفاوت نشان دادند. 35 قطعه با موفقیت توالی یابی شد که 11 قطعه شباهتی با توالیهای نوکلئوتیدی ثبت شده در پایگاه اطلاعاتی بانک های ژن نشان نداده و به عنوان ژنهای کاندیدای جدید سیستم دفاعی سیب زمینی در برابر r. solanacearum معرفی می شوند. از این میان 24 قطعه cdna تشابه با توالی ژنهای کد کننده پروتئین های شناخته شده از گروه های مختلفی که در فرایندهای دفاع در برابر بیماری ها، واکنش عمومی به تنش ها، متابولیسم، ساختار و فیزیولوژی سلول، نسخه برداری و تنظیم بیان ژنها، ترجمه و بسته بندی پروتئین ها ایفای نقش می نمایند نشان دادند. در الگوی cdna-aflp تعامل ناسازگار (فوق حساسیت) توتون با باکتری r. solanacearum 1320 قطعه cdna با استفاده از پنج ترکیب آغازگری بدست آمد که 101 قطعه بیان متفاوت داشتند از بین آنها 14 قطعه منتخب توالی یابی شدند که 11 قطعه با ژن های کد کننده پروتئین های دخیل در فرایند های دفاعی، ساختاری، سیگنالینگ و تنظیم مشابهت داشتند. در مطالعه روند تغییرات بیان ژن های منتخب دفاعی، بیان کیتیناز a ، b و pr-10a در ارقام مقاوم و متحمل نسبت به رقم حساس مارفونا افزایش داشت و احتمالا در پروسه های دفاعی در برابر این باکتری ایفای نقش می نمایند. اما بیان ژن گلوکناز در هر سه رقم مقاوم، متحمل و حساس نسبتا در یک سطح بوده و تغییرات محسوسی در بیان این ژن در واکنش به باکتری مشاهده نشد احتمالا ژن گلوکناز در این پاتوسیستم نقش مهمی ایفا نمی نماید.

در اکثر قریب به اتفاق جدایه های باکتری erwinia amylovora پلاسمید غیر قابل انتقال pea29 وجود دارد. علی رغم شباهت جدایه های این گونه، تفاوت در دامنه میزبانی و بیماری زایی در ارتباط با وجود پلاسمید و تنوع آن می باشد. تحقیق حاضر با هدف بررسی تنوع پلاسمیدی در جدایه های ایرانی عامل سوختگی آتشی، تکثیر قطعه psti از پلاسمید pea29 و هضم آنزیمی آن و بررسی وجود تعداد ردیف های تکراری کوتاه در جدایه های مربوط به میزبانهای مختلف و از مناطق مختلف جغرافیایی انجام گرفته است. با انجام آزمونهای فنوتیپی و بیماریزایی، از مجموع چهل و سه جدایه، 24 جدایه برای آزمون تشخیصی lfic، سنجش لوان سوکروز و مطالعات مولکولی انتخاب شدند. روش lfic قادر به ردیابیcfu/ml 106- 105 باکتری در عصاره گیاهی آلوده می باشد. همچنین ارتباطی بین میزان ترشح لوان سوکروز و شدت بیماریزایی جدایه ها مشخص نگردید. صحت وجود پلاسمید pea29 با استفاده از سه جفت آغازگر تشخیصی مرتبط بررسی گردید. آغازگرهای ea71(1)/ea71(2)، به عنوان دقیق ترین جفت در شناسایی جدایه های ea می باشند. ردیابی مولکولی سایر پلاسمیدهای ea با استفاده از 5 جفت آغازگر اختصاصی، حاکی از عدم تنوع پلاسمیدی در جدایه های ایران است. به غیر از pea29، جدایه های بدست آمده از زالزالک و به، حامل peu72 می باشند. هضم آنزیمی قطعه psti از پلاسمید pea29 جدایه های ایرانی توسط آنزیم برشی hpaii، جدایه های ایرانی را در چهار گروه قرار داد. چند شکلی مشاهده شده در طول قطعه بزرگتر و بین 360 تا 400 جفت باز متغیر است. جدایه های گروه 1 از منابع مختلف دانه دار و از استانهای مختلف ایران مربوط به سالهای مختلف در کنار جدایه استاندارد ea273 قرار گرفتند. گروه 2 در برگیرنده جدایه هایی از گلابی، به و زالزالک می باشد. جدایه های گروه 3 مربوط به استان لرستان و کمترین تعداد جدایه مربوط به گروه 4 بدست آمده از گیاه رز می باشند. بر اساس گروهبندی آنزیمی تعداد 15 جدایه برای تعیین توالی ناحیه psti انتخاب شدند. واحدهای تکراری به صورت attacaga در جدایه های ایران 4، 5، 7، و 8 بار تکرار می شوند. تمام جدایه های ea بدست آمده از سیب از مناطق جغرافیایی مختلف ایران دارای تعداد واحد تکراری 4 هستند که با نتایج حاصل از هضم آنزیمی مطابقت دارد. بر اساس داده های بررسی حاضر، شاخص تعداد واحدهای ssr، می تواند برای گروه بندی جدایه های ea استفاده شود و در بسیاری موارد ارتباط گروه بندی با منشاء جغرافیایی، نوع میزبان و سال جمع آوری مشاهده می گردد. ولی اطلاعات چندانی در رابطه با مبدا آلودگی و نحوه گسترش بیمارگر سوختگی آتشی در کشور بدست نمی آید.

نژاد 3، بیووار 2 از کمپلکس گونه‏ای ralstonia solanacearumخسارات اقتصادی قابل توجهی را به سیب زمینی در سراسر دنیا وارد می‏سازد. لذا دستیابی به روش ردیابی حساس و اختصاصی به منظور حذف مواد گیاهی آلوده در مراکز تحقیقات و ایستگاههای بازرسی قرنطینه گیاهی ضروری می‏باشد