بسیاری از فعالیت های انسان پیامدهای غیرقابل جبرانی برای محیط زیست دارد. بطوریکه امروزه تخریب محیط زیست کل حیات کره زیست کره را تهدید می کند. خارج کردن ضایعات به روش ایمنی از محیط زیست انسان برای ادامه تمدن ضروری است. خاک واسطه برگشت مجدد این ضایعات محسوب می گردد. بنابراین حفاظت از خاک در جهت حفظ محیط زیست و ادامه حیات انسان ضروری است. برای پاکسازی خاک روش های متعددی وجود دارد که تکنیک گیاه پالایی یا پاکسازی گیاهی یکی از ارزانترین این روش هاست که علاوه بر حذف آلودگی خاک منجر به ایجاد فضای سبز می گردد. هدف از این پژوهش مطالعه سیستم ریشه ای ذرت در حذف آلودگی نفتی بود. برای این منظور رشد و سبز شدن ذرت در سه نوع خاک شامل: نوع اول گلدان های حاوی خاک همراه با غلظت 1-6% نفت خام، نوع دوم گلدان های حاوی غلظت 2% نفت خام ( p0= خاک شاهد، p1 = خاک حاوی غلظت 2% نفت خام و pf = p1 همراه با 500 میلی گرم آمونیوم نیترات و 50 میلی گرم پتاسیم دی هیدروژن فسفات ) و نوع سوم گلدان حاوی خاک آلوده پالایشگاه جنوب تهران ( c0 = خاک شاهد، c1 = حاوی خاک آلوده پالایشگاه و cf = c1 همراه با 25 میلی گرم پتاسیم مونو هیدروژن فسفات، 50 میلی گرم اوره و 15 میلی گرم سوپر فسفات) مورد بررسی قرار گرفت. نتایج نشان داد که درصد سبز شدن در خاک های آلوده به نفت کاهش یافت. کاهش رشد، وزن تر و خشک گیاه و رنگیزه های فتوسنتزی به دلیل کاهش هوادهی، رطوبت پذیری پایین و افزایش موادسمی در خاک آلوده به نفت مشاهده شد. همچنین اثر آلاینده های نفتی بر میزان برخی عناصر ماکرو مورد بررسی قرار گرفت. نتایج افزایش میزان سدیم، فسفر، منیزیم و کاهش پتاسیم را نشان داد. کاهش میزان پلی ساکارید ها در گیاهان رشد یافته در خاک آلوده به نفت مشاهده شد. میزان مالون دآلدهید در برگ وریشه گیاهان رشد یافته در خاک pf نسبت به دو تیمار دیگر افزایش یافت. این امر در مورد میزان پرولین در ریشه نیز مشاهده شد، اما وضعیت در برگ برعکس بود. میزان ترکیبات فنلی در برگ گیاهان رشد یافته در خاک pf افزایش نشان داد و در ریشه گیاهان رشد یافته در خاک آلوده کاهش میزان ترکیبات فنلی و فلاونوئید مشاهده شد. میزان پروتئین در گیاهان رشد یافته درخاک آلوده افزایش یافت. فعالیت آنزیم پراکسیداز درگیاهان رشد یافته در خاک آلوده افزایش نشان داد. این امر در مورد آنزیم سوپراکسید دیسموتاز برعکس بود. شمارش باکتری های ناحیه ریزوسفر کاهش تعداد باکتری ها را در خاک p1 و pf نسبت به p0 نشان داد. مقاوم ترین باکتری به نفت خام شناسایی شد و بررسی ها با آنالیز فیلوژنتیکی s rrna 16 نشان داد که این باکتری مربوط به جنس brachybacterium sp. می باشد.