نام پژوهشگر: رعنا صمدی پاکچین

استخراج و تخلیص پروتئین hu از باکتری halobacillus karajensis
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه الزهراء - دانشکده علوم پایه 1390
  رعنا صمدی پاکچین   پریناز قدم

میکروارگانیسم ها برای فشرده کردن dna سلولی از گروهی از پروتئین های بازی استفاده می کنند. این گروه از پروتئین ها اثرات عمیقی بر روی بیان ژن ها، نوترکیبی، همانندسازی dna، رشد و توانایی حیات دارند و به عنوان پروتئین های شبه هیستونی شناخته می شوند. از جمله ی این پروتئین ها می توان به hu، h-ns، fis و اشاره کرد. پروتئین های hu برای نگهداری ساختار نوکلئوئید ضروری هستند. بعلاوه آنها در وظایف وابسته به dna شامل همانندسازی، ترمیم، نوترکیبی و تنظیم ژن ها نیز شرکت می کنند. با توجه به این توانایی ها، پروتئین های hu بیشتر به عنوان عوامل ساختاری عمل می کنند و با ایجاد یک توپولوژی ویژه از dna، گردهمایی ساختارهای پیشرفته ی نوکلئوپروتئینی را ارتقاء می بخشند. اگرچه پروتئین های hu از لحاظ تکاملی در بین یوباکتری ها بسیار حفاظت شده هستند با این وجود هر کدام ازآنها به مناطق ویژه ای مربوط به خود تمایل دارند و متصل می-شوند. وجود این چنین تفاوت هایی نشان دهنده ی تکامل وظایفی این پروتئین ها و نقش های متفاوت آنها در داخل سلول است. با توجه به اهمیت این پروتئین و اینکه این پروتئین تا کنون در یک باکتری هالوفیل بررسی نشده است لذا ما در این پژوهش این پروتئین را در باکتری halobacillus karajensis مورد بررسی قرار دادیم. در این پژوهش باکتری halobacillus karajensis در نوترینت براث حاوی 10% nacl کشت داده شد بیومس در فاز لگاریتمی رشد جمع آوری شد. پروتئین ها بوسیله ی ترسیب با آمونیوم سولفات رسوب داده شدند (40-%90). سپس پروتئین های استخراج شده بر روی ژل sds page مورد بررسی قرار گرفت، درصد مناسب از آمونیوم سولفات انتخاب شد و رسوب آن بر روی ستون deae-sepharose cl-6b برده شد. سرانجام فرکشن های حاصل از کروماتوگرافی بوسیله ی وسترن بلاتینگ چک شدند تا آنهایی که دارای پروتئینی با خواص ایمنولوژیکی مشابه hbsu هستند مشخص شوند و مشاهده شد که فرکشن های ابتدائی چنین هستند. pi پروتئین خاص شده تعیین گردید. نتیجه گیری: باکتری halobacillus karajensis دارای یک پروتئین مشابه از لحاظ ایمنولوژیکی با hbsu است که دارای pi برابر با 5/9 می باشد.