هدف از انجام این تحقیق بررسی مراحل مختلف تولید بیودیزل از ریزجلبک به خصوص مرحله استخراج روغن و واکنش تبادل استری بوده است. تعیین نرخ باروری زیست توده و محتوی لیپید دو گونه ریزجلبک کلرولا اس پی. و اسپیرولینا پلانتسیس برای انتخاب بهترین گونه برای تولید بیودیزل از اهداف اولیه تحقیق بوده است. دو عامل کلیدی محتوی لیپید و ترکیب اسید چرب برای تعیین کارآیی استخراج روغن و دو عامل بازده بیودیزل و ترکیب متیل استر اسید چرب (fame) در بیودیزل برای تعیین کارآیی واکنش تبادل استری مستقیم در نظرگرفته شده است. ریزجلبک کلرولا با رشد سریع و باروری 2/0 تا 5/0 گرم زیست توده خشک بر هر لیتر کشت نسبت به ریزجلبک اسپیرولینا با رشد آهسته و باروری 1/0 تا 3/0 گرم زیست توده خشک بر هر لیتر کشت برتری خود را در این زمینه نشان داده است. این در حالی است که محتوی لیپید ریزجلبک کلرولا نیز مقدار 2/26 % را نتیجه داده است که نسبت به ریزجلبک اسپیرولینا با محتوی لیپید 3/14 % تفاوت چشمگیری را نشان می دهد. ترکیب اسید چرب های اصلی به صورت میریستیک اسید c14:0))، پالمیتیک اسید c16:0))، پالمیتولیلوئیک اسیدc16:1))، اولئیک اسید (c18:1)، لین اولئیک اسیدc18:2)) به ترتیب 8/27 %، 5/11 %، 1/35 %، 9/4 % و3/13 % برای ریزجلبک کلرولا و به ترتیب برای 0 %، 3/59 %، 9/2 %، 7/6 % و 3/11 % ریزجلبک اسپیرولینا به دست آمده است. بازده بیودیزل برای روش تبادل استری مستقیم مقدار 2/28 % به دست آمده است و ترکیب fame بیودیزل گرفته شده از ریزجلبک کلرولا اس پی. عبارتند از متیل تترادکانوات c14:0))، متیل هگزادکانوات (c16:0)، متیل 9-هگزادکانوات c16:1)) و متیل 9.12-اوکتادکادینوات c18:2)) که به ترتیب شامل2/29 %، 1/10 %، 2/37 % و 8/13 % می باشند.