در پژوهش حاضر، سه گونه باکتریایی بیمارگر erwinia carotovora، xanthomonas axonopodis و streptomyces turgidiscabies به منظور یافتن پکتیناز خارج سلولی که توانایی شکست پکتین مرکبات با درجه استریفیه بالا را دارد، مورد بررسی قرار گرفت. در این میان، گونه xanthomonas axonopodis دارای بهترین فعالیت پکتینازی می باشد. بهینه سازی شرایط کشت نشان داد که این باکتری در محیط حاوی1/0% پکتین مرکبات، 1% پپتن، 1%yeast extract در دمایc° 30با 7ph و rpm 180در روز پنجم (u/ml0.64) بهترین فعالیت آنزیمی را دارد. آنزیم تخلیص شده، بوسیله تلفیقی از دو ستون کروماتوگرافی تعویض یونی deae-cellulose و sephacryl s-200 gel filtration خالص گردید. این آنزیم یک پکتیناز دیمر با وزن مولکولیkda 104 به کمک gel filtration و kda 56 به کمکsds-page می باشد. آنزیم پلی متیل گالاکتوروناز فعالیت بهینه خود را در oc 60 و 6 ph با vmax و km به ترتیب µmol/min 066/0 وmg/ml 51/2 پکتین به عنوان سوبسترا انجام می دهد. آنزیم در طیف وسیعی از ph (9-5) و دمای بالا (تا oc 90) پایدار است. حضورmm 5 از یون هـای +ca2+, cu2+, mg2+,mn2 و+ co2 به شکل مشخص باعث افزایش فعالیت و حضور hg2+ و fe2+ فعالیت را به شدت کاهش می دهد. از آنجایی که edta اثری مهاری بر روی فعالیت پکتینازی آنزیم نشان می دهد، می توان گفت که آنزیم به فلز برای فعالیت خود وابسته است. در مجموع، بر اساس ویژگی های این پکتیناز از جمله اسیدی بودن و مقاومت بالای دمایی آن، پیشنهاد می شود که این آنزیم می تواند یک انتخاب مطلوب برای آبگیری و شفاف سازی در صنایع تولید آبمیوه، خصوصاً مرکبات باشد.