چکیده ویروس آنفلوانزا متعلق به خانواده ی orthomyxoviridae است که دارای ژنوم rna تک رشته ای 8 قطعه ای و با سنس منفی می باشد. قطعه ماتریکس (m) دو پروتئین m1 و m2 را کد می کند. مطالعات پیشین آشکار کرده اند که پروتئین m2 عملکرد کانال یونی را داشته که تقریباً در میان تمام تحت تیپ های ویروس a آنفلوانزا، بخصوص h5n1 و h9n2 حفاظت شده است و به عنوان گزینه ای نوید دهنده جهت توسعه ی واکسن نوترکیب وسیع الطیف علیه آنفلوانزای a تلقی می گردد. هدف از این پژوهش ارزیابی توالی اسید های نوکلئیک ژن m2در ویروس های آنفلوانزای h9n2 جداشده در شهرکرد و به دنبال آن بررسی میزان حفاظت شدگی ژنm2 در نمونه های اخذ شده است. بدین منظور استخراج کامل rna از مایع آلانتوئیک تخم مرغ جنین دار آلوده شده به ویروس صورت گرفت. سپس rt-pcr بر روی نمونه های مذکور انجام شد. پس از تأیید محصول اختصاصی pcr روی ژل آگارز یک درصد، توالی اسید های نوکلیئک محصول به دست آمده تعیین و ارزیابی گردید. نتایج حاصل از مقایسه ی ردیف نوکلئوتیدی تعیین شده در این مطالعه با تعدادی از سکانس های شناخته شده ی ژنm2 در کشورمان و سایر نقاط جهان (موجود در بانک ژن) نشانگر وجود 92 تا 99 درصد شباهت ژنتیکی بود. این نتایج نشان می دهد که ژنm2 تاحدود زیادی حفاظت شده است و می تواند آنتی ژن مناسبی برای تولید واکسن جهانی علیه آنفلوانزا باشد.