اداره و هدایت کارا و اثربخش هر واحد اقتصادی نیازمند در اختیار داشتن اطلاعات قابل اتکا و به موقع می باشد. تحقق این مهم نیز به نوبه ی خود، مستلزم استقرار یک سیستم حسابداری مناسب است. تردیدی نیست که مدیران سازمان ها پیوسته در موقعیت هایی قرار دارند که نیازمند گزینش یک راه حل ارجح از میان شقوق مختلف عمل و اتخاذ تصمیماتی درست و سودمند می باشند. با وجود اینکه امروزه کمتر کسی در خصوص نقش مهم و برجسته ی اطلاعات و به ویژه اطلاعات مالی و حسابداری در تمامی مراحل تصمیم سازی مدیران تردید دارد اما شواهد تجربی نشان می دهد که در میان بخش عمده ای از بنگاه های اقتصادی و به ویژه واحدهای کوچک خلاء وجود اطلاعات به موقع و قابل اتکا یکی از عمده ترین چالش های مدیریت علمی و از جمله موانع مهم توسعه اینگونه بنگاه های اقتصادی می باشد. بررسی های اولیه نشان می دهد که بخش عظیمی از بنگاه های اقتصادی کوچک از سیستم های اطلاعاتی حسابداری مطلوب بی بهره اند. بر این اساس هدف اصلی این تحقیق آسیب شناسی سیستم های حسابداری و گزارشگری مالی در شرکت های کوچک و مطالعه و بررسی علل و عوامل احتمالی موثر بر عدم کارآمدی این سیستم ها در شرکت های کوچک می باشد و همچنین پاسخگویی به این سوال است که دلایل عدم کارآمدی سیستم حسابداری و گزارشگری مالی در شرکت های کوچک چیست. نمونه ی آماری تحقیق از بین شرکت های کوچک فعال استان سیستان و بلوچستان و برای دوره های مالی 1386 لغایت 1388 انتخاب شده است. برای گردآوری اطلاعات از مشاهده عینی و مصاحبه با مدیران شرکت و همچنین مسئولان حسابداری هر واحد و پرسشنامه استفاده گردید. یافته های تحقیق نشان می دهد که عواملی از جمله میزان تجربه ی کارکنان بخش مالی، فاصله ی بین نیازهای شغلی شاغلان حرفه ی حسابداری و آموزش های دانشگاهی در رشته های مرتبط، نظامات مطلوب جبران خدمت کارکنا ن بخش مالی و میزان آگاهی مدیریت واحد تجاری از مباحث مالی رابطه ی مستقیم با میزان کارآمدی سیستم حسابداری و گزارشگری مالی دارند و عواملی از قبیل صلاحیت تخصصی کارکنان بخش مالی، وجود الزامات قانونی و قراردادی در خصوص بکارگیری کارکنان بخش مالی و نظارت و کنترل مالیاتی بر عملکرد مالی شرکت با کارآمدی سیستم حسابداری و گزارشگری مالی ارتباط معنادار ندارند. کلمات کلیدی: آسیب شناسی، سیستم حسابداری و گزارشگری مالی، شرکت های کوچک