پژوهش در زمینه ی پیاده سازی استراتژی های سازمانی به واسطه ی افزایش بکارگیری برنامه های استراتژیک و نیاز مدیران برای هدایت موفقیت آمیز فرایند اجرا اهمیت فراوانی یافته است. پژوهش حاضر با درک ضرورت یاد شده، در قالب یک پژوهش پیمایشی و کاربردی به بررسی مسائل و موانع موجود در پیاده سازی استراتژی در صنعت داروی ایران اختصاص یافته است. بدین منظور در وهله ی نخست تلاش شد تا پاسخی برای این پرسش که چه عواملی به عنوان موانع اجرای استراتژی می توانند فرایند پیاده سازی استراتژی در صنعت دارو را دچار چالش نمایند، داده شود و سپس عوامل شناسایی شده بر حسب میزان اهمیت و تاثیرگذاری اولویت بندی شوند. به منظور بررسی های آماری از نمونه ای به حجم 112 نفر از مدیران و کارشناسان ارشد شرکت های تولیدکننده ی دارو که در سندیکای صاحبان صنایع داروهای انسانی ایران عضویت دارند، استفاده گردید. نتایج حاصل از بررسی های آماری نشان می دهد که 9 عامل تدوین استراتژی، رابطه ی میان واحدهای سازمانی و گونه های استراتژی، مجریان استراتژی، ارتباطات، تاکتیک های عملیاتی، اجماع، تعهد، ساختار سازمانی و سیستم های اداری در صورت ناکارآمدی می توانند به عنوان مهمترین موانع پیاده سازی استراتژی در صنعت دارو معرفی بگردند. از میان عوامل یاد شده بیشترین تاثیر متعلق به ناکارآمدی در تدوین استراتژی است و پس از آن متغیرهای ساختار سازمان، مجریان استراتژی، رابطه میان واحدهای سازمانی و گونه های استراتژی، سیستم های اداری، ارتباطات، تعهد و تاکتیک های عملیاتی در جایگاه های بعد قرار گرفتند و کمترین میزان تاثیرگذاری نیز به متغیر اجماع نسبت داده شد. بدین ترتیب نتایج این پژوهش می تواند مدیران صنعت دارو را در هدایت فرایند اجرا و فایق آمدن بر موانع موجود در حین پیاده سازی استراتژی یاری نماید.